Authors: Hazard D, Moreno C, Foulquié D, Delval E, François D, Bouix J, Sallé G, Boissy A
(Contact: dominique.hazard@toulouse.inra.fr ) Affiliation: INRA, UMR1388 Génétique, Physiologie et Systèmes d'Elevage, F-31326 Castanet-Tolosan, France Title: Identification of QTLs for behavioral reactivity to social separation and humans in sheep using the OvineSNP50 BeadChip Journal: BMC Genomics, 15: 778 (2014)
DOI :
10.1186/1471-2164-15-778 Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Vocalization during arena test
Chr.1 : QTL:146933 . Chr.2 : QTL:140501 , QTL:140511 , QTL:146909 , QTL:146914 , QTL:146926 , QTL:146936 . Chr.3 : QTL:140512 , QTL:146928 , QTL:146938 . Chr.5 : QTL:140492 , QTL:146916 , QTL:146929 . Chr.6 : QTL:140493 , QTL:146907 . Chr.7 : QTL:146906 , QTL:146917 . Chr.8 : QTL:140494 , QTL:146897 , QTL:146918 . Chr.9 : QTL:140506 , QTL:146930 . Chr.10 : QTL:140502 . Chr.11 : QTL:146919 . Chr.12 : QTL:140503 , QTL:146899 , QTL:146911 , QTL:146934 . Chr.13 : QTL:140495 , QTL:140507 , QTL:146912 , QTL:146923 . Chr.14 : QTL:140513 . Chr.15 : QTL:140491 , QTL:140496 , QTL:146913 . Chr.16 : QTL:140497 , QTL:140514 , QTL:146894 , QTL:146908 , QTL:146924 , QTL:146935 . Chr.17 : QTL:140498 , QTL:146904 . Chr.18 : QTL:140508 , QTL:146931 . Chr.19 : QTL:140504 , QTL:146925 . Chr.20 : QTL:146927 , QTL:146937 . Chr.21 : QTL:140499 , QTL:140509 , QTL:146898 , QTL:146915 , QTL:146932 . Chr.22 : QTL:146910 . Chr.23 : QTL:140510 . Chr.24 : QTL:140505 . Chr.25 : QTL:140500 . Chr.26 : QTL:146905 .
QTL for Locomotion during arena test
Chr.2 : QTL:140515 , QTL:146939 . Chr.3 : QTL:140516 , QTL:146921 . Chr.4 : QTL:146940 . Chr.5 : QTL:140517 , QTL:146941 . Chr.7 : QTL:146922 . Chr.8 : QTL:140518 , QTL:146942 . Chr.9 : QTL:146943 . Chr.19 : QTL:146892 , QTL:146944 . Chr.23 : QTL:146900 , QTL:146945 . Chr.24 : QTL:146920 .
QTL for Cortisol level
Chr.19 : QTL:140519 .
QTL for Vocalization during corridor test
Chr.3 : QTL:146951 . Chr.5 : QTL:146947 . Chr.6 : QTL:140520 . Chr.9 : QTL:146949 . Chr.12 : QTL:146950 . Chr.13 : QTL:140522 , QTL:146948 . Chr.17 : QTL:146946 . Chr.23 : QTL:140523 . Chr.26 : QTL:140521 .
QTL for Vocalization during isolation box test
Chr.1 : QTL:140524 , QTL:146953 . Chr.5 : QTL:146956 . Chr.10 : QTL:140525 . Chr.12 : QTL:140526 . Chr.16 : QTL:140527 , QTL:146954 . Chr.17 : QTL:146955 . Chr.26 : QTL:140528 , QTL:146957 .
QTL for Locomotion during isolation box test
Chr.2 : QTL:146959 . Chr.4 : QTL:140529 . Chr.16 : QTL:140530 . Chr.17 : QTL:140531 . Chr.19 : QTL:140532 , QTL:146958 . Chr.20 : QTL:146962 . Chr.21 : QTL:140533 , QTL:146960 . Chr.23 : QTL:146961 .
QTL for Vocalization behavior
Chr.2 : QTL:146866 , QTL:146901 . Chr.3 : QTL:146863 . Chr.4 : QTL:146870 . Chr.5 : QTL:146871 . Chr.6 : QTL:146883 . Chr.7 : QTL:146868 . Chr.9 : QTL:146872 . Chr.10 : QTL:146884 . Chr.12 : QTL:146895 , QTL:146896 . Chr.13 : QTL:146859 , QTL:146864 , QTL:146885 , QTL:146888 . Chr.16 : QTL:146893 , QTL:146903 . Chr.17 : QTL:146886 . Chr.21 : QTL:146860 , QTL:146887 . Chr.23 : QTL:146889 . Chr.24 : QTL:146890 . Chr.26 : QTL:146861 , QTL:146867 , QTL:146880 .
QTL for Reactivity to humans
Chr.4 : QTL:147075 . Chr.6 : QTL:146862 , QTL:147087 . Chr.7 : QTL:147076 . Chr.10 : QTL:147072 , QTL:147080 . Chr.12 : QTL:146881 , QTL:147073 , QTL:147077 , QTL:147079 , QTL:147088 . Chr.15 : QTL:146873 . Chr.16 : QTL:147081 . Chr.17 : QTL:146869 , QTL:147070 , QTL:147082 . Chr.18 : QTL:146874 , QTL:146882 , QTL:147089 . Chr.20 : QTL:147078 , QTL:147085 . Chr.23 : QTL:146865 , QTL:146902 , QTL:146952 , QTL:147083 , QTL:147086 . Chr.24 : QTL:147074 . Chr.26 : QTL:146875 , QTL:147071 , QTL:147084 .
QTL for Locomotor activity
Chr.2 : QTL:146891 . Chr.5 : QTL:146876 . Chr.8 : QTL:146984 . Chr.19 : QTL:146877 . Chr.23 : QTL:146878 . Chr.25 : QTL:146879 .
QTL for Breech Traits
Chr.1 : QTL:146963 . Chr.2 : QTL:146967 , QTL:146979 . Chr.3 : QTL:146981 . Chr.5 : QTL:146969 . Chr.6 : QTL:146973 . Chr.7 : QTL:146970 , QTL:146980 . Chr.9 : QTL:146971 . Chr.10 : QTL:146964 . Chr.11 : QTL:146975 . Chr.12 : QTL:146972 , QTL:146976 . Chr.13 : QTL:146965 , QTL:146977 . Chr.16 : QTL:146974 . Chr.17 : QTL:146966 , QTL:146978 . Chr.21 : QTL:146983 . Chr.24 : QTL:146982 . Chr.26 : QTL:146968 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (4) ,
Chr.2 (14) ,
Chr.3 (8) ,
Chr.4 (4) ,
Chr.5 (10) ,
Chr.6 (7) ,
Chr.7 (7) ,
Chr.8 (6) ,
Chr.9 (6) ,
Chr.10 (6) ,
Chr.11 (2) ,
Chr.12 (15) ,
Chr.13 (12) ,
Chr.14 (1) ,
Chr.15 (4) ,
Chr.16 (13) ,
Chr.17 (11) ,
Chr.18 (5) ,
Chr.19 (8) ,
Chr.20 (5) ,
Chr.21 (10) ,
Chr.22 (1) ,
Chr.23 (12) ,
Chr.24 (5) ,
Chr.25 (2) ,
Chr.26 (11) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Hazard D, Moreno C, Foulquié D, Delval E, François D, Bouix J, Sallé G, Boissy A (2014). Identification of QTLs for behavioral reactivity to social separation and humans in sheep using the OvineSNP50 BeadChip. BMC genomics, 15: 778;
Curated into QTLdb on 2017-12-01. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=SgZo1K0ZuE
OR
Hazard D, Moreno C, Foulquié D, Delval E, François D, Bouix J, Sallé G, Boissy A (2014). Identification of QTLs for behavioral reactivity to social separation and humans in sheep using the OvineSNP50 BeadChip. BMC genomics, 15: 778; DOI: https://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-15-778
