Authors:
Mandel A, Reißmann M, Brockmann GA, Korkuć P
(Contact: paula.korkuc@hu-berlin.de )
Affiliation:
Albrecht Daniel Thaer-Institute for Agricultural and Horticultural Sciences, Animal Breeding and Molecular Genetics, Humboldt-Universität zu Berlin, Invalidenstr. 42, 10115 Berlin, Germany
Title:
Whole-Genome Insights into the Genetic Basis of Conformation Traits in German Black Pied (DSN) Cattle
Journal:
Genes, 16(4):445 (2025)
DOI :
10.3390/genes16040445
Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Rump width reported for chromosome(s):
Chr.8 : Asso:320675 , Asso:320726 . Chr.21 : Asso:320626 , Asso:320627 , Asso:320628 , Asso:320629 , Asso:320630 , Asso:320632 , Asso:320633 , Asso:320634 , Asso:320635 , Asso:320637 , Asso:320643 , Asso:320653 , Asso:320693 , Asso:320694 , Asso:320701 , Asso:320730 , Asso:320731 , Asso:320732 , Asso:320738 , Asso:320739 , Asso:320740 , Asso:320741 , Asso:320742 .
QTL for Teat length reported for chromosome(s):
Chr.22 : Asso:320631 .
QTL for Body condition score reported for chromosome(s):
Chr.2 : Asso:320660 , Asso:320718 . Chr.10 : Asso:320733 . Chr.24 : Asso:320636 .
QTL for Udder height reported for chromosome(s):
Chr.6 : Asso:320638 .
QTL for Feet and leg conformation reported for chromosome(s):
Chr.6 : Asso:320639 . Chr.24 : Asso:320727 . Chr.26 : Asso:320715 .
QTL for Conformation score reported for chromosome(s):
Chr.21 : Asso:320640 .
QTL for Rear leg placement - side view reported for chromosome(s):
Chr.13 : Asso:320677 . Chr.19 : Asso:320664 . Chr.20 : Asso:320641 , Asso:320647 , Asso:320651 , Asso:320652 , Asso:320668 , Asso:320683 , Asso:320684 , Asso:320706 , Asso:320708 .
QTL for Strength reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:320642 .
QTL for Udder attachment reported for chromosome(s):
Chr.4 : Asso:320654 , Asso:320666 . Chr.17 : Asso:320644 , Asso:320646 , Asso:320657 , Asso:320659 , Asso:320661 , Asso:320662 , Asso:320667 , Asso:320669 , Asso:320670 , Asso:320672 , Asso:320673 , Asso:320674 , Asso:320676 , Asso:320679 , Asso:320680 , Asso:320681 , Asso:320682 , Asso:320685 , Asso:320686 , Asso:320687 , Asso:320688 , Asso:320689 , Asso:320690 , Asso:320692 , Asso:320695 , Asso:320696 , Asso:320697 , Asso:320698 , Asso:320699 , Asso:320700 , Asso:320703 , Asso:320704 , Asso:320705 , Asso:320710 , Asso:320711 , Asso:320712 , Asso:320713 , Asso:320714 , Asso:320716 , Asso:320717 , Asso:320720 , Asso:320721 , Asso:320722 , Asso:320723 , Asso:320724 , Asso:320725 , Asso:320728 , Asso:320729 , Asso:320736 , Asso:320737 .
QTL for Locomotion reported for chromosome(s):
Chr.12 : Asso:320645 , Asso:320655 .
QTL for Rump angle reported for chromosome(s):
Chr.7 : Asso:320678 . Chr.26 : Asso:320648 .
QTL for Dairy form reported for chromosome(s):
Chr.20 : Asso:320649 .
QTL for Udder cleft reported for chromosome(s):
Chr.15 : Asso:320650 , Asso:320665 , Asso:320671 , Asso:320691 , Asso:320702 , Asso:320707 , Asso:320719 , Asso:320734 , Asso:320735 . Chr.18 : Asso:320656 , Asso:320658 , Asso:320663 , Asso:320709 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (1) ,
Chr.2 (2) ,
Chr.4 (2) ,
Chr.6 (2) ,
Chr.7 (1) ,
Chr.8 (2) ,
Chr.10 (1) ,
Chr.12 (2) ,
Chr.13 (1) ,
Chr.15 (9) ,
Chr.17 (50) ,
Chr.18 (4) ,
Chr.19 (1) ,
Chr.20 (10) ,
Chr.21 (24) ,
Chr.22 (1) ,
Chr.24 (2) ,
Chr.26 (2) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Mandel A, Reißmann M, Brockmann GA, Korkuć P (2025). Whole-Genome Insights into the Genetic Basis of Conformation Traits in German Black Pied (DSN) Cattle. Genes, 16(4):445;
Curated into QTLdb on 2025-10-15. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=KhKx9J8UjN
OR
Mandel A, Reißmann M, Brockmann GA, Korkuć P (2025). Whole-Genome Insights into the Genetic Basis of Conformation Traits in German Black Pied (DSN) Cattle. Genes, 16(4):445; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/genes16040445