Authors: Crespo-Piazuelo D, Criado-Mesas L, Revilla M, Castelló A, Noguera JL, Fernández AI, Ballester M, Folch JM
(Contact: daniel.crespo@cragenomica.es ) Affiliation: Departament de Ciència Animal i dels Aliments, Facultat de Veterinària, Universitat Autònoma de Barcelona (UAB), 08193, Bellaterra, Spain Title: Identification of strong candidate genes for backfat and intramuscular fatty acid composition in three crosses based on the Iberian pig Journal: Scientific Reports, 10(1): 13962 (2021)
DOI :
10.1038/s41598-020-70894-2 Links:
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QTL for Oleic acid to stearic acid ratio
Chr.14 : Asso:218056 , Asso:218057 , Asso:218058 , Asso:218059 , Asso:218060 , Asso:218061 , Asso:218062 , Asso:218063 , Asso:218064 , Asso:218065 , Asso:218075 , Asso:218076 , Asso:218077 , Asso:218078 , Asso:218079 , Asso:218080 , Asso:218081 , Asso:218089 , Asso:218090 , Asso:218091 , Asso:218092 .
QTL for Monounsaturated fatty acid to saturated fatty acid ratio
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QTL for Stearic acid content
Chr.14 : Asso:218082 , Asso:218083 , Asso:218084 , Asso:218085 , Asso:218086 , Asso:218093 .
QTL for Eicosatrienoic acid content
Chr.4 : Asso:218095 , Asso:218097 , Asso:218099 . Chr.13 : Asso:218094 , Asso:218096 , Asso:218098 .
QTL for Arachidonic acid to dihomo-gamma-linolenic acid ratio
Chr.4 : Asso:218100 , Asso:218101 .
QTL for Arachidic acid content
Chr.17 : Asso:218102 , Asso:218103 , Asso:218104 , Asso:218105 .
QTL for Palmitic acid content
Chr.8 : Asso:218106 , Asso:218107 , Asso:218109 , Asso:218110 , Asso:218111 , Asso:218115 , Asso:218120 , Asso:218204 , Asso:218215 , Asso:218234 , Asso:218254 , Asso:218274 , Asso:218277 .
QTL for Myristic acid content
Chr.8 : Asso:218150 , Asso:218200 , Asso:218201 , Asso:218207 , Asso:218212 , Asso:218214 , Asso:218249 , Asso:218273 , Asso:218276 . Chr.12 : Asso:218108 , Asso:218112 , Asso:218116 , Asso:218119 , Asso:218123 , Asso:218124 , Asso:218130 , Asso:218131 , Asso:218132 , Asso:218134 , Asso:218136 , Asso:218196 .
QTL for Monounsaturated fatty acid to polyunsaturated fatty acid ratio
Chr.2 : Asso:218113 , Asso:218114 , Asso:218125 , Asso:218126 , Asso:218127 , Asso:218133 , Asso:218135 , Asso:218151 , Asso:218152 , Asso:218160 , Asso:218161 , Asso:218170 , Asso:218171 , Asso:218205 , Asso:218206 , Asso:218258 , Asso:218271 , Asso:218272 . Chr.4 : Asso:218183 , Asso:218213 , Asso:218235 , Asso:218259 .
QTL for Linoleic acid content
Chr.2 : Asso:218117 , Asso:218118 , Asso:218137 , Asso:218138 , Asso:218153 , Asso:218154 , Asso:218157 , Asso:218162 , Asso:218163 , Asso:218164 , Asso:218184 , Asso:218197 , Asso:218216 , Asso:218223 , Asso:218224 , Asso:218260 , Asso:218261 , Asso:218262 , Asso:218263 .
QTL for Polyunsaturated fatty acid content
Chr.2 : Asso:218121 , Asso:218122 , Asso:218142 , Asso:218143 , Asso:218155 , Asso:218156 , Asso:218158 , Asso:218159 , Asso:218165 , Asso:218166 , Asso:218198 , Asso:218199 , Asso:218228 , Asso:218229 , Asso:218241 , Asso:218264 , Asso:218265 , Asso:218266 , Asso:218270 .
QTL for Cis-11-Eicosenoic acid to arachidic acid ratio
Chr.16 : Asso:218128 , Asso:218129 , Asso:218139 , Asso:218140 , Asso:218141 , Asso:218144 , Asso:218145 , Asso:218146 , Asso:218147 , Asso:218148 , Asso:218149 , Asso:218180 , Asso:218185 , Asso:218186 , Asso:218187 , Asso:218188 , Asso:218189 , Asso:218190 , Asso:218191 , Asso:218192 , Asso:218193 , Asso:218225 , Asso:218226 , Asso:218227 , Asso:218230 , Asso:218231 , Asso:218232 , Asso:218233 , Asso:218242 , Asso:218244 , Asso:218250 , Asso:218251 , Asso:218252 , Asso:218253 , Asso:218279 .
QTL for Palmitoleic acid content
Chr.8 : Asso:218167 , Asso:218168 , Asso:218169 , Asso:218217 , Asso:218236 , Asso:218237 , Asso:218245 , Asso:218246 , Asso:218275 , Asso:218278 .
QTL for Oleic acid content
Chr.2 : Asso:218172 , Asso:218173 , Asso:218174 , Asso:218175 , Asso:218176 , Asso:218177 , Asso:218178 , Asso:218181 , Asso:218182 , Asso:218202 , Asso:218203 , Asso:218247 , Asso:218267 , Asso:218268 .
QTL for Dihomo-gamma-linolenic acid content
Chr.6 : Asso:218179 , Asso:218208 , Asso:218221 . Chr.10 : Asso:218222 , Asso:218248 .
QTL for Polyunsaturated fatty acid to saturated fatty acid ratio
Chr.2 : Asso:218194 , Asso:218195 , Asso:218211 , Asso:218255 , Asso:218256 , Asso:218257 , Asso:218269 .
QTL for Monounsaturated fatty acid content
Chr.2 : Asso:218209 , Asso:218210 , Asso:218218 , Asso:218219 , Asso:218220 , Asso:218238 , Asso:218239 , Asso:218240 , Asso:218243 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Crespo-Piazuelo D, Criado-Mesas L, Revilla M, Castelló A, Noguera JL, Fernández AI, Ballester M, Folch JM (2021). Identification of strong candidate genes for backfat and intramuscular fatty acid composition in three crosses based on the Iberian pig. Scientific reports, 10(1): 13962;
Curated into QTLdb on 2021-02-16. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=CuQj4F5MuM
OR
Crespo-Piazuelo D, Criado-Mesas L, Revilla M, Castelló A, Noguera JL, Fernández AI, Ballester M, Folch JM (2021). Identification of strong candidate genes for backfat and intramuscular fatty acid composition in three crosses based on the Iberian pig. Scientific reports, 10(1): 13962; DOI: https://dx.doi.org/10.1038/s41598-020-70894-2
