Authors:
Nonneman D, Lents C, Rohrer G, Rempel L, Vallet J
(Contact: dan.nonneman@ars.usda.gov )
Affiliation:
USDA-ARS, U.S. Meat Animal Research Center, Clay Center, NE, 68933-0166, USA.
Title:
Genome-wide association with delayed puberty in swine.
Journal:
Animal Genetics, 45(1): 130-2 (2014)
DOI :
10.1111/age.12087
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Age at puberty reported for chromosome(s):
Chr.1 : Asso:21989 , Asso:21990 , Asso:21991 , Asso:21992 , Asso:21993 , Asso:21994 , Asso:21995 , Asso:21996 , Asso:21997 , Asso:21998 , Asso:21999 , Asso:22000 , Asso:22001 , Asso:22002 , Asso:22003 , Asso:22004 , Asso:22005 . Chr.2 : Asso:21978 , Asso:22006 , Asso:22007 , Asso:22008 , Asso:22009 , Asso:22010 , Asso:22011 , Asso:22012 , Asso:32745 . Chr.3 : Asso:22013 , Asso:22014 , Asso:22015 , Asso:22016 . Chr.4 : Asso:21979 , Asso:21980 , Asso:22017 , Asso:22018 , Asso:22019 , Asso:22020 , Asso:22021 , Asso:22022 , Asso:22023 , Asso:22024 , Asso:22025 , Asso:22026 , Asso:22027 , Asso:22028 , Asso:32746 . Chr.5 : Asso:21981 , Asso:21982 , Asso:22029 , Asso:22030 , Asso:22031 , Asso:22032 , Asso:22033 , Asso:22034 , Asso:22035 , Asso:22036 , Asso:22037 , Asso:22038 , Asso:22039 , Asso:22040 , Asso:32747 , Asso:32748 . Chr.6 : Asso:22041 , Asso:22042 , Asso:22043 , Asso:22044 , Asso:22045 , Asso:22046 , Asso:22047 , Asso:22048 , Asso:22049 , Asso:22050 , Asso:22051 , Asso:22052 , Asso:22053 , Asso:22054 , Asso:22055 , Asso:22056 . Chr.7 : Asso:21983 , Asso:21984 , Asso:22057 , Asso:22058 , Asso:22059 , Asso:22060 , Asso:22061 , Asso:22062 , Asso:22063 , Asso:22064 , Asso:22065 , Asso:22066 , Asso:22067 , Asso:22068 , Asso:22069 , Asso:22070 , Asso:22071 , Asso:22072 , Asso:22073 , Asso:22074 , Asso:22075 , Asso:22076 , Asso:22077 , Asso:22078 , Asso:22129 , Asso:32749 , Asso:32750 , Asso:32751 . Chr.8 : Asso:21985 , Asso:22079 , Asso:22080 , Asso:22081 , Asso:22082 , Asso:22083 , Asso:22084 , Asso:22085 , Asso:32752 . Chr.9 : Asso:22086 , Asso:22087 , Asso:22088 , Asso:22089 , Asso:22090 , Asso:22091 , Asso:22092 . Chr.10 : Asso:21986 , Asso:32753 . Chr.11 : Asso:22093 , Asso:22094 . Chr.12 : Asso:22095 , Asso:22096 , Asso:22097 . Chr.13 : Asso:22098 , Asso:22099 , Asso:22100 , Asso:22101 , Asso:22102 , Asso:22103 , Asso:22104 , Asso:22105 , Asso:22106 , Asso:22107 . Chr.14 : Asso:22108 , Asso:22109 , Asso:22110 , Asso:22111 , Asso:22112 , Asso:22113 , Asso:22114 , Asso:22115 . Chr.15 : Asso:21987 , Asso:22116 . Chr.16 : Asso:22117 , Asso:22118 , Asso:22119 , Asso:22120 , Asso:22121 . Chr.17 : Asso:22122 , Asso:22123 , Asso:22124 , Asso:22125 . Chr.18 : Asso:21988 , Asso:22126 , Asso:22127 , Asso:22128 , Asso:32754 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (17) ,
Chr.2 (9) ,
Chr.3 (4) ,
Chr.4 (15) ,
Chr.5 (16) ,
Chr.6 (16) ,
Chr.7 (28) ,
Chr.8 (9) ,
Chr.9 (7) ,
Chr.10 (2) ,
Chr.11 (2) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.13 (10) ,
Chr.14 (8) ,
Chr.15 (2) ,
Chr.16 (5) ,
Chr.17 (4) ,
Chr.18 (5) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Nonneman D, Lents C, Rohrer G, Rempel L, Vallet J (2014). Genome-wide association with delayed puberty in swine.. Animal genetics, 45(1): 130-2;
Curated into QTLdb on 2013-10-21. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=AlLq4N7IcS
OR
Nonneman D, Lents C, Rohrer G, Rempel L, Vallet J (2014). Genome-wide association with delayed puberty in swine.. Animal genetics, 45(1): 130-2; DOI: https://dx.doi.org/10.1111/age.12087