Authors: Easa AA, Selionova M, Aibazov M, Mamontova T, Sermyagin A, Belous A, Abdelmanova A, Deniskova T, Zinovieva N
(Contact: ahmed.allam@agr.dmu.edu.eg; n_zinovieva@mail.ru ) Affiliation: Timiryazev Agricultural Academy, Russian State Agrarian University-Moscow, Timiryazevskaya Street, 41, Moscow 127550, Russia Title: Identification of Genomic Regions and Candidate Genes Associated with Body Weight and Body Conformation Traits in Karachai Goats Journal: Genes, 13(10):1773 (2022)
DOI :
10.3390/genes13101773 Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body length
Chr.1 : Asso:285519 . Chr.2 : Asso:285522 . Chr.3 : Asso:285511 , Asso:285532 , Asso:285551 . Chr.5 : Asso:285525 , Asso:285533 , Asso:285535 , Asso:285555 . Chr.6 : Asso:285514 , Asso:285516 , Asso:285546 . Chr.8 : Asso:285515 , Asso:285550 . Chr.9 : Asso:285526 , Asso:285537 . Chr.10 : Asso:285512 , Asso:285517 , Asso:285523 , Asso:285524 , Asso:285531 , Asso:285544 , Asso:285554 . Chr.11 : Asso:285545 . Chr.12 : Asso:285527 , Asso:285538 . Chr.13 : Asso:285509 , Asso:285521 , Asso:285541 . Chr.15 : Asso:285553 . Chr.16 : Asso:285542 , Asso:285543 . Chr.17 : Asso:285518 , Asso:285534 , Asso:285547 . Chr.18 : Asso:285508 , Asso:285540 . Chr.20 : Asso:285548 . Chr.21 : Asso:285536 , Asso:285539 . Chr.26 : Asso:285528 , Asso:285552 . Chr.27 : Asso:285549 . Chr.28 : Asso:285530 . Chr.29 : Asso:285510 , Asso:285513 , Asso:285520 , Asso:285529 .
QTL for Body weight
Chr.1 : Asso:285561 , Asso:285573 , Asso:285580 . Chr.5 : Asso:285558 , Asso:285562 , Asso:285567 , Asso:285568 , Asso:285574 , Asso:285579 . Chr.6 : Asso:285556 , Asso:285559 . Chr.10 : Asso:285557 , Asso:285563 , Asso:285572 , Asso:285576 . Chr.11 : Asso:285566 . Chr.16 : Asso:285560 , Asso:285571 , Asso:285577 , Asso:285582 . Chr.18 : Asso:285570 . Chr.20 : Asso:285581 . Chr.24 : Asso:285564 , Asso:285569 , Asso:285578 . Chr.25 : Asso:285565 . Chr.26 : Asso:285575 .
QTL for Body depth
Chr.9 : Asso:285584 , Asso:285586 , Asso:285588 . Chr.13 : Asso:285585 , Asso:285590 . Chr.17 : Asso:285587 , Asso:285589 . Chr.18 : Asso:285583 .
QTL for Body circumference
Chr.4 : Asso:285607 . Chr.5 : Asso:285598 . Chr.6 : Asso:285595 , Asso:285609 . Chr.7 : Asso:285602 . Chr.9 : Asso:285592 , Asso:285597 , Asso:285600 . Chr.10 : Asso:285591 , Asso:285604 , Asso:285612 . Chr.12 : Asso:285596 , Asso:285601 , Asso:285608 . Chr.13 : Asso:285599 . Chr.17 : Asso:285606 , Asso:285611 . Chr.18 : Asso:285593 . Chr.19 : Asso:285594 . Chr.20 : Asso:285603 . Chr.24 : Asso:285605 . Chr.25 : Asso:285610 .
QTL for Chest width
Chr.1 : Asso:285626 , Asso:285634 , Asso:285664 , Asso:285704 , Asso:285711 , Asso:285738 . Chr.2 : Asso:285637 , Asso:285643 , Asso:285658 , Asso:285669 , Asso:285701 , Asso:285702 , Asso:285703 , Asso:285715 , Asso:285722 , Asso:285742 . Chr.3 : Asso:285635 , Asso:285640 , Asso:285642 , Asso:285648 , Asso:285662 , Asso:285663 , Asso:285673 , Asso:285688 , Asso:285714 , Asso:285728 . Chr.4 : Asso:285621 , Asso:285633 , Asso:285639 , Asso:285657 , Asso:285687 , Asso:285725 . Chr.5 : Asso:285613 , Asso:285676 , Asso:285709 , Asso:285723 , Asso:285741 . Chr.6 : Asso:285734 , Asso:285740 . Chr.7 : Asso:285632 , Asso:285644 , Asso:285661 , Asso:285680 , Asso:285712 , Asso:285727 . Chr.8 : Asso:285649 . Chr.9 : Asso:285619 , Asso:285622 , Asso:285631 , Asso:285645 , Asso:285650 , Asso:285651 , Asso:285653 , Asso:285686 , Asso:285689 , Asso:285716 , Asso:285718 , Asso:285737 . Chr.10 : Asso:285615 , Asso:285616 , Asso:285620 , Asso:285638 , Asso:285666 , Asso:285667 , Asso:285668 , Asso:285670 , Asso:285674 , Asso:285679 , Asso:285681 , Asso:285691 , Asso:285693 , Asso:285694 , Asso:285705 . Chr.11 : Asso:285655 , Asso:285696 , Asso:285739 . Chr.12 : Asso:285614 , Asso:285684 , Asso:285721 , Asso:285726 , Asso:285730 . Chr.13 : Asso:285710 , Asso:285731 . Chr.14 : Asso:285660 , Asso:285672 , Asso:285690 , Asso:285698 , Asso:285717 , Asso:285735 . Chr.15 : Asso:285675 , Asso:285706 , Asso:285729 . Chr.16 : Asso:285707 . Chr.17 : Asso:285627 , Asso:285641 , Asso:285646 , Asso:285682 , Asso:285685 , Asso:285719 . Chr.18 : Asso:285618 , Asso:285665 . Chr.19 : Asso:285720 , Asso:285733 . Chr.20 : Asso:285623 , Asso:285624 , Asso:285736 . Chr.21 : Asso:285625 , Asso:285697 . Chr.22 : Asso:285636 , Asso:285647 , Asso:285732 . Chr.24 : Asso:285629 , Asso:285630 . Chr.26 : Asso:285628 , Asso:285652 , Asso:285654 , Asso:285656 , Asso:285699 , Asso:285713 , Asso:285724 . Chr.27 : Asso:285659 . Chr.28 : Asso:285617 , Asso:285677 , Asso:285692 . Chr.29 : Asso:285671 , Asso:285678 , Asso:285683 , Asso:285695 , Asso:285700 , Asso:285708 .
QTL for Body height
Chr.1 : Asso:285750 , Asso:285814 . Chr.2 : Asso:285756 , Asso:285785 , Asso:285843 . Chr.3 : Asso:285743 , Asso:285763 , Asso:285778 , Asso:285780 , Asso:285826 , Asso:285846 , Asso:285847 , Asso:285850 , Asso:285859 . Chr.4 : Asso:285757 , Asso:285776 , Asso:285836 . Chr.5 : Asso:285770 , Asso:285771 , Asso:285784 , Asso:285844 . Chr.6 : Asso:285752 , Asso:285755 , Asso:285792 , Asso:285823 , Asso:285854 . Chr.7 : Asso:285761 , Asso:285845 . Chr.8 : Asso:285745 , Asso:285795 , Asso:285813 , Asso:285825 , Asso:285834 . Chr.9 : Asso:285751 , Asso:285754 , Asso:285772 , Asso:285815 , Asso:285832 . Chr.10 : Asso:285746 , Asso:285753 , Asso:285767 , Asso:285786 , Asso:285787 , Asso:285794 , Asso:285812 , Asso:285816 , Asso:285821 , Asso:285827 , Asso:285830 , Asso:285831 , Asso:285839 , Asso:285842 , Asso:285856 . Chr.11 : Asso:285773 , Asso:285777 , Asso:285840 , Asso:285849 . Chr.12 : Asso:285762 . Chr.13 : Asso:285760 , Asso:285783 , Asso:285788 , Asso:285791 , Asso:285824 , Asso:285837 , Asso:285858 , Asso:285860 . Chr.15 : Asso:285764 , Asso:285835 , Asso:285838 , Asso:285848 . Chr.16 : Asso:285766 , Asso:285774 , Asso:285775 , Asso:285782 , Asso:285789 , Asso:285851 , Asso:285852 , Asso:285855 . Chr.17 : Asso:285779 , Asso:285790 , Asso:285822 . Chr.18 : Asso:285744 , Asso:285765 , Asso:285811 . Chr.20 : Asso:285781 , Asso:285796 , Asso:285833 , Asso:285841 , Asso:285857 . Chr.26 : Asso:285749 , Asso:285758 , Asso:285769 , Asso:285817 , Asso:285819 , Asso:285829 . Chr.27 : Asso:285793 . Chr.28 : Asso:285828 . Chr.29 : Asso:285747 , Asso:285748 , Asso:285759 , Asso:285768 , Asso:285818 , Asso:285820 , Asso:285853 .
QTL for Rump width
Chr.1 : Asso:285799 . Chr.2 : Asso:285797 . Chr.3 : Asso:285798 . Chr.4 : Asso:285809 . Chr.8 : Asso:285807 . Chr.9 : Asso:285800 , Asso:285808 . Chr.12 : Asso:285801 , Asso:285804 . Chr.14 : Asso:285803 . Chr.16 : Asso:285806 . Chr.18 : Asso:285805 . Chr.20 : Asso:285810 . Chr.25 : Asso:285802 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (13) ,
Chr.2 (15) ,
Chr.3 (23) ,
Chr.4 (11) ,
Chr.5 (20) ,
Chr.6 (14) ,
Chr.7 (9) ,
Chr.8 (9) ,
Chr.9 (27) ,
Chr.10 (44) ,
Chr.11 (9) ,
Chr.12 (13) ,
Chr.13 (16) ,
Chr.14 (7) ,
Chr.15 (8) ,
Chr.16 (16) ,
Chr.17 (16) ,
Chr.18 (11) ,
Chr.19 (3) ,
Chr.20 (12) ,
Chr.21 (4) ,
Chr.22 (3) ,
Chr.24 (6) ,
Chr.25 (3) ,
Chr.26 (16) ,
Chr.27 (3) ,
Chr.28 (5) ,
Chr.29 (17) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Easa AA, Selionova M, Aibazov M, Mamontova T, Sermyagin A, Belous A, Abdelmanova A, Deniskova T, Zinovieva N (2022). Identification of Genomic Regions and Candidate Genes Associated with Body Weight and Body Conformation Traits in Karachai Goats. Genes, 13(10):1773;
Curated into QTLdb on 2023-11-02. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=AjJq2G9QrZ
OR
Easa AA, Selionova M, Aibazov M, Mamontova T, Sermyagin A, Belous A, Abdelmanova A, Deniskova T, Zinovieva N (2022). Identification of Genomic Regions and Candidate Genes Associated with Body Weight and Body Conformation Traits in Karachai Goats. Genes, 13(10):1773; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/genes13101773
