chromosome 2

100800 bytes allocated in orders_morecore

3024000 bytes allocated in morecore

Option chosen: chrompic


Current values for parameters:

par_file = chr2.par
dat_file = chr2.dat
gen_file = chr2.gen
ord_file = chr2.ord
nb_our_alloc = 3000000    [# bytes reserved for our_alloc]
SEX_EQ = 1   [0 = sex specific analysis, 1 = sex equal]
TOL = 0.010000
PUK_NUM_ORDERS_TOL = 6
PK_NUM_ORDERS_TOL = 8
PUK_LIKE_TOL = 2.000
PK_LIKE_TOL = 2.000
use_ord_file = 0
write_ord_file = 0
use_haps = 1



Haplotyped system (distances forced to 0.0):

  0   CRYG1-5               2   CRYG1-5_2             4   CRYG1-5_3           


Haplotyped system (distances forced to 0.0):

  1   D2S54                 3   D2S54_2             

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 24   D2S38_2              23   D2S38               

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 40   D2S5_2               39   D2S5                

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 42   D2S1_2               41   D2S1                

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 44   TPO                  45   TPO_2               

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 54   APOB_2               53   APOB                

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 64   D2S61_2              63   D2S61               

Haplotyped system (distances forced to 0.0):

 75   TGFA_3               73   TGFA_2               72   TGFA                
 76   TGFA_4              

N.B. Only the first locus in each set is retained in the orders
objects, but the remaining loci are used in all likelihood calculations.



  0   CRYG1-5             
 21   D2S40               
 55   D2S51               
 61   LCT                 
 68   D2S44               
 77   Prot_C/pcr          
  1   D2S54               
 49   LCO                 
 20   D2S41               
 69   D2S43               
 10   D2S25               
 33   D2S62               
 24   D2S38_2             
 59   D2S45               
 26   D2S30               
 28   D2S31               
 40   D2S5_2              
 31   D2S28               
 66   D2S6                
 17   D2S19               
 70   D2S46               
 56   D2S48               
 54   APOB_2              
 50   D2S70               
 44   TPO                 
 65   D2S47               
 42   D2S1_2              
  5   ACP1                



gen_file = chr2.gen


Family 1326   phase likelihood = 1.000, 2d best = 0.000


    3 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    6 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    7 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    8 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    9 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1327   phase likelihood = 1.000, 2d best = 0.000


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    6 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    7 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    8 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0


Family 1328   phase likelihood = 0.185, 2d best = 0.087


    3 o-----i--- ---------- ---i-iiii- ------    1
         1 CRYG1-5  
      ------i--- ---------- ---o-oi-i- --i--i    2
         7 D2S44  

    4 o-----o--- ---------- ---o-oi-o- ------    2
         27 D2S48  29 APOB  
      ------o--- ---------- ---o-oo-o- --o--o    0

    5 o-----o--- ---------- ---o-oiii- ------    1
      ------o--- ---------- ---o-io-o- --i--i    3
         26 D2S46  

    6 i-----i--- ---------- ---o-ooii- ------    2
      ------i--- ---------- ---i-ii-o- --o--o    1

    7 o-----o--- ---------- ---o-oooo- ------    0
      ------i--- ---------- ---i-ii-o- --o--o    1

    8 o-----i--- ---------- ------ioo- ------    2
         1 CRYG1-5  
      ------o--- ---------- ------i-i- --i--i    1
         7 D2S44  

    9 i-----i--- ---------- ------oii- ------    2
         27 D2S48  
      ------i--- ---------- ------i-i- --o--o    1

   10 i-----i--- ---------- ---i--iii- ------    0
      ------o--- ---------- ---i--i-i- --o--o    2
         7 D2S44  

   11 i-----o--- ---------- ---i-iii-- ------    2
         1 CRYG1-5  7 D2S44  
      ------i--- ---------- ---i-ii--- -----i    0

   12 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 13281   phase likelihood = 0.976, 2d best = 0.024


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------1--- ---------- -------0-0 ----0-    1
         7 D2S44  
      ------1--- ---------- --------0- ------    1
         7 D2S44  29 APOB  

    4 ------0--- ---------- -----o-0-0 ----0-    0
      ------1--- ---------- --------1- ------    0

    5 ------0--- ---------- -----i11-1 ----1-    1
         7 D2S44  
      ------1--- ---------- --------0- ------    1
         7 D2S44  29 APOB  

   10 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   11 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   12 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   13 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   14 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1329   phase likelihood = 0.079, 2d best = 0.079


    3 ---------- o--------- ---i-oo--- -----i    3
         11 LCO  24 D2S6  36 ACP1  
      i-----i--- ---------- ------ii-- ------    0

    4 ---------- i--------- ---i-oo--- -----o    1
      i-----i--- ---------- ------ii-- ------    0

    5 ---------- i--------- ---i-ii--- -----i    0
      i-----i--- ---------- ------oo-- ------    1

    6 ---------- o--------- ---o-oo--- -----i    1
         36 ACP1  
      o-----o--- ---------- ------oo-- ------    0

Family 13291   phase likelihood = 0.551, 2d best = 0.195


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ----111--- -i-1----i- --11--1111 ---0--    1
         34 D2S1_2  
      0----00000 -o00-0--o0 ---------- 11----    1

    4 ----000--- -o-0----0- --11--0000 ---1--    3
         34 D2S1_2  
      0----11111 -i00-0--00 ---------- 11----    3
         1 CRYG1-5  

    5 ----0o0--- -0-0----0- --00--0000 ---1--    1
         34 D2S1_2  
      0----o0000 -o00-0--0- ---------- 00----    0

    6 ----011--- -0-0----i- --11--1111 ---1--    3
         5 D2S51  
      0----00000 -o00-0--o0 ---------- 11----    1

    7 ----000--- ---1----i- --11--1111 ---1--    1
      1----1111- --00-0--o0 ---------- 11----    2

    8 ----0o0--- -o-0----i- --11--1111 ---1--    1
      0----o0111 -i11-1--o0 ---------- 00----    2

    9 ----111--- -i-1----i- --01--1000 ---0--    3
         23 D2S28  
      0----000-- -o00-0--o- ---------- -0----    0

   14 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 13292   phase likelihood = 0.676, 2d best = 0.194


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------0--- i1ii111-0- ---1--i-11 --0-o1    5
         7 D2S44  19 D2S30  36 ACP1  
      0----000-- i-11-11-1- --------i- -1---1    1

    4 ------1--- 11oo000-00 ---0--o-o0 --0-oo    1
      1----100-- 0-00-00-11 --------i- -1---i    2

    5 ------1--- 11io000-0o ---1--i-00 --0-oo    3
      0----000-- 0-o0-00-0o --------o- -1---i    1

    6 ------1--- i1ii111--i ---1--i-i1 --0-o0    1
      1----111-- i-11-11--i --------o- -0---0    1

    7 ------0--- o0oo-00-00 ---0----11 --0-o0    2
      0----000-- o-00-00-01 --------i- -1---0    2
         36 ACP1  

    8 ------0--- o0oo000-0o ---0--o--0 --0-oo    0
      0----000-- o-00-00-0o ---------- -1---i    1

    9 ---------- 11ii11i-1i ---1--i--1 --1-i-    0
      0----0-0-- 0-o0-0o-1i ---------- -1----    1

Family 13293   phase likelihood = 0.786, 2d best = 0.098


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------0--- -0-----00- i-1i-----0 ii-111    3
         30 D2S70  
      -----111-- 1i-111--11 i---i--1-i 1i----    0

    4 ------1--- -o-----11- o-0o-----o oo-000    3
         7 D2S44  12 D2S41  
      -----000-- 0o-000--00 o---o--0-o 0o----    0

    5 ------1--- -1-----11- 0-0i-----i i1-111    2
      -----111-- 1o-000--11 1---i--1-i 00----    3

    6 ------0--- -0-----10- 0-0o-----0 oo-000    2
         18 D2S45  
      -----111-- -i-111--11 1---i--1-i 0o----    1

    7 ------0--- -i-----11- 1-1i-----1 ii-111    1
         7 D2S44  
      -----111-- 1i-111--00 0---o--0-o 1i----    2

    8 ------1--- -1-----11- i-1i-----0 o0-000    1
      -----111-- 1o-000--00 i---i--1-i 11----    2

    9 ------0--- -1-----00- o-0i-----1 o0-00-    4
         7 D2S44  12 D2S41  
      -----000-- 0o-000--00 o---o--0-o 11----    1

Family 13294   phase likelihood = 0.853, 2d best = 0.084


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---0-00--- -o0000---1 1--1i-i1i- -1----    1
      ------0--o 0ooi-1---0 ----o---01 -i1---    3

    4 ---0-11--- -i1000---0 0--0o-o0o- -i----    3
         4 D2S40  32 TPO_2  
      ------1--i 1iii-1---1 ----o---o0 -o0---    1

    5 ---1-11--- -ii111---i 1--0o-o0o- -1----    2
         32 TPO_2  
      ------0--o 00oi-1---i ----i---11 -i1---    1

    6 ---0-11--- -i1110---0 0--1i-i1i- -1----    3
         4 D2S40  
      ------1--i 1iii-1---1 ----i---i1 -i1---    0

    7 ---1-1---- -i-000---o 0--0o----- -1----    2
         32 TPO_2  
      ---------- -0-o-0---o ----o----- -i----    1
         32 TPO_2  

    8 ---0-00--- -o0000---i 1--1i-i1i- -o----    2
         32 TPO_2  
      ------0--o 0ooo-0---i ----i---i1 -i1---    1

   13 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   14 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1330   phase likelihood = 0.100, 2d best = 0.100


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ii----0--o ---------- ---i--i-00 ------    3
      ------1-1i --1----0-- ---i---iii --0---    3
         18 D2S45  33 D2S47  

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 oo----1--i ---------- ---1--i-ii ------    1
      ------0-0o --0----0-- ---0---iii --1---    1

    6 ii----1--i ---------- ---i--i-ii ------    0
      ------0-0o --1----0-- ---i----ii --1---    3
         13 D2S43  18 D2S45  

    7 ii----1--i ---------- ---i--i-ii ------    0
      ------0-0o --0----0-- ---i---iii --0---    2
         33 D2S47  

Family 1331   phase likelihood = 0.434, 2d best = 0.336


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ----i--1-- 11i1-11--- -0-o------ 0----o    1
      ------11-- 1--1-ii1i- ---1i---1- 0-o0-o    1

    4 ----i--o-- o0oo-00--- -1-i--i--- 1----i    2
         5 D2S51  
      ------1i-- i--i-ii1i- ---ii-1-1- 1-i1-i    0

    5 ----o--o-- o0o0-00--- -1-i--o--- -----0    2
      ------1i-- i--0-oo0o- ---0o-0-0- --i1-1    2

    6 ----o--i-- 00o0-00--- -1-i--i--- 0----o    4
         5 D2S51  8 Prot_C/pcr  
      ------0o-- 0--0-oo0o- ---0o-o-0- 0-o0-o    0

    7 ----o--o-- o0oo-00--- -1-o--o--- 0----o    2
         22 D2S5  
      ------1i-- i--i-ii1i- ---1i-0-0- 0-o0-o    1

    8 ----o--0-- 00o0-00--- ---o--o--- 1----1    1
      ------00-- 0--0-oo-o- ---oo-0-0- 0-o0-0    0

    9 ----o--1-- 11i1-11--- ---i--i--- 0----o    2
         5 D2S51  
      ------11-- 1--1-ii1i- ---ii-1-1- 0--0-o    1

   10 ----i--i-- i1ii-00--- -0-i--i--- 1----i    2
      ------0o-- o--o-oo-o- ---0o-o-0- 0-o1-i    1

   11 ----i--0-- 00o0-00--- ---o--o--- 0----0    1
         5 D2S51  
      ------00-- 0--0-oo-o- ---oo-0-0- 0-i1-1    1

   16 ----i--1-- 1-i------- ---i------ 1-----    0
      -------1-- 1--------- ---0------ 1-i---    2
         24 D2S6  

   17 ----o--0-- 0-o------- ---o------ 1-----    1
         31 TPO  
      -------0-- 0--------- ---o------ 1-i---    1

Family 1332   phase likelihood = 0.398, 2d best = 0.218


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 00-1i-1i-i -i1-i---ii -1i-ii---- --ii--    1
      ---0--0o-o ----i1--1- --ii1----- 1-1---    1

    4 11--o-1i-i --1-0----- -----i---- -oo---    5
         5 D2S51  15 D2S62  26 D2S46  
      ------0o-o ----1----- ---i------ 1-1---    1

    5 11-ii-11-- -i1-0---oo --0-ii---- -iii--    2
      ---i--11-- ----11--1- --1i1----- 0-0---    1

    6 11-0o-0o-o -o0-----ii -11-io---- -ooo--    3
      ---1--1i-i -----1--0- --0oo----- --0---    1

    7 00--i-1i-i -i1-1---io -0o-oo---- -iii--    3
      ------0o-o ----00--0- --oo0----- 0-0---    0

    8 11-0i-01-i -i1-i---ii -1i-i----- -iii--    4
         4 D2S40  5 D2S51  7 D2S44  
      ---1--11-1 ----i1--1- --ii1----- 1-1---    0

    9 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   10 11-io-0o-o -o0-0---oo -00-ii---- -ooo--    3
      ---i--1i-i ----11--1- --1i1----- 1-1---    0

   11 00----0o-o --0-0---o- -01--i---- -iii--    1
      ------1i-i ----1---0- --0o------ 1-1---    2

   12 11-1i-1i-i -i1-1---ii --1-i----- -iii--    0
      ---0--0o-o ----00--0- --0oo----- 1-1---    1

   17 -------1-- ---------- ---------- ------    0
      -------1-- ---------- ---------- ------    0

Family 1333   phase likelihood = 0.429, 2d best = 0.190


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---01-1-1- -1i-1111i- --1ii---0- --1-11    3
         4 D2S40  29 APOB  
      ------1i-- ---1---1i1 ---ii-i--- ----0-    1
         35 D2S1  

    4 ---11-1-1- -0o--000o- --1i1---0- --1-11    4
         29 APOB  
      ------0o-- ---0---0o0 ---00-o--0 ----0-    0

    5 ---00-0-0- -0o--00oo- --0o0---0- --0-o0    0
      ------0o-- ---1---ii1 ---11-i--- ----o-    2
         35 D2S1  

    6 ---11-1-1- -1i-111ii- --1i1---0- --0-00    1
      ------0o-- ---0---oo0 ---00-o--0 ----1-    1
         35 D2S1  

    7 ---10-0-0- -0o-000oo- --0o0---0- --0-o0    1
         4 D2S40  
      ------1i-- ---1---ii1 ---11-i--0 ----o-    1

    8 ---01-0-0- -1i-111ii- --0oo---1- --1-11    5
         4 D2S40  5 D2S51  
      ------0o-- ---0---oo0 ---oo-o--0 ----0-    0

    9 ---01-0-0- -0o-000ii- --1oo---0- --1-11    5
         4 D2S40  5 D2S51  
      ------1i-- ---1---oo0 ---oo----0 ----0-    1

   10 ---10-0-0- -1i-1111i- --1o0---1- --1-i0    5
         4 D2S40  36 ACP1  
      ------1o-- ---1---1i1 ---11-i--- ----i-    2
         7 D2S44  8 Prot_C/pcr  

   15 ---------- ---------- ---------- ------    0
      -------o-- ---------- ---------- ------    0

Family 1334   phase likelihood = 0.783, 2d best = 0.108


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 --o0000--- -0-0o--1o- --00--0-0- -000--    2
         18 D2S45  
      ---------- --0-o0---- --o0--0-00 0-0o--    0

    4 --o-000--- ---00--0-- ---i-ii-i- -11---    1
      ---------- --1-i1---- ---o--o-o0 1-1---    2

    5 --o1111--- -1-1i--1i- --11-i1-1- -111--    1
         3 CRYG1-5_3  
      ---------- --1-i1---- --i1--1-11 1-1i--    0

    6 --o0111--- ---11--1i- --11-i1-1- -11i--    1
      ---------- --0-o0---- --o1--1-11 0-0o--    2

    7 --o0000--- -0-0o--1i- --1i-ii-i- -111--    1
      ---------- --0-o0---- --oo--o-o0 1-1i--    1

    8 --i-011--- -0-0o--0o- --0o--o-o- -00o--    3
         3 CRYG1-5_3  5 D2S51  
      ---------- --0-o0---- --ii--i-i1 1-1i--    1

    9 --i1111--- -0-00---o- --01--o-o- -00o--    3
         24 D2S6  
      ---------- --1-i1---- --i1--i-i1 1-1i--    0

Family 1340   phase likelihood = 0.318, 2d best = 0.199


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -------0-- -------0-- ----011-i1 -i-0--    2
         34 D2S1_2  
      ---------- --i11---11 ---------- -o-o-1    2
         36 ACP1  

    4 -------0-- 0------0-- ----110--0 -0-0--    2
      ---------- --i11---11 ---------- -0-o-0    1

    5 -------0-- 0------0-- ----111--0 -0-0--    2
      ---------- --i11---11 ---------- -0-o-0    1

    6 -------0-- -------0-- ----000--0 -o-0--    0
      ---------- --o00---11 ---------- -i-o-0    2

    7 -------0-- 0--------- ----000--0 -i-i--    1
      ---------- --i11---11 ---------- -o-o-0    1

    8 -------1-- 0--------- ----110-i- -0-i--    6
         8 Prot_C/pcr  11 LCO  27 D2S48  29 APOB  32 TPO_2  34 D2S1_2  
      ---------- --i11---11 ---------- -0-o-0    1

   13 -------0-- 0--------- -----10--0 -o----    2
         26 D2S46  
      ---------- --i-1----- ---------- -i---1    0

Family 1341   phase likelihood = 0.569, 2d best = 0.229


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -i------0- oo------1- 1--ii--000 -i--i-    4
         2 CRYG1-5_2  
      -oo1--1--- --11-1--0- ---o----0- -o0-o0    2

    4 11------11 ii------1- 1--ii---i1 -o--0-    1
      -1i0--0--- --00-0--0- ---o----o- -00-00    1

    5 11------11 ii------0- 0--oo--0o0 -o--0-    1
      -1i0--0--- --00-0--1- ---i----i- -00-00    3

    6 -i-------- oo------o- 0--ii---i1 -o--0-    3
         2 CRYG1-5_2  
      -oo1--1--- --10-0--o- ---o----o- -00-0-    2

    7 11-------- oo------i- 1--1i---11 -i--1-    2
      -1i1--1--- --00-0--i- ---i----1- -11-11    2

    8 -i------11 ii------o- 0--0i---i1 -o--o-    3
      -oo0--1--- --10-0--o- ---o----o- -i1-i1    3

    9 -i------11 ii------o- 0--0o---i1 -i--o-    3
         35 D2S1  
      -oo0--0--- --00-0--o- ---o----o- -11-i1    1

   10 11------0- oo------1- 1--1i--0o0 -o--0-    3
      -1i1--1--- --10-0--0- ---i----i- -00-00    3

Family 1344   phase likelihood = 0.477, 2d best = 0.477


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ----o-0o-- -o------o0 ---0-0-000 --0o--    0
      ooo---0o-- 000--o0--- --o---0--0 --0o-0    0

    4 ----o-0o-- -o-------1 ---1-1-111 --11--    1
      iii---1i-- 111--i1--- --i---1--1 --0o-0    1

    5 ----o-0o-- -i------o0 ---1-1-11- --0o--    4
         12 D2S41  
      ooo---0o-- 000--o0--- --o---1--- --0o-0    2
         27 D2S48  

    6 ----o-1i-- ---------- ---0-0-00o --1---    3
         5 D2S51  33 D2S47  
      ooo---1i-- 1-1------- ------1--i --1--1    1

    7 -------o-- -o-------1 ---1------ ---1--    1
      -------o-- 00---o0--- --o------- ---o-0    0

    8 ----o-0o-- -o------i1 ---1-1-000 --0o--    2
      iii---0o-- -00--i1--- --i---0--0 --0o-0    3

    9 ----o-1i-- -i------o0 ---0-0-11i --11--    3
         5 D2S51  
      iii---0o-- 000--o0--- --o---0--o --0o-0    1

   10 ----o-0o-- -o------i1 ---0-0-111 --00--    4
      iii---1i-- 111--i1--- --i---1--1 --1i-1    0

   11 ----o-0o-- -o------o0 ---1-1-11i --0o--    2
      ooo---1i-- 111--o0--- --o---0--o --0o-0    2

Family 1345   phase likelihood = 0.170, 2d best = 0.170


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---o--11-- --i-i--1-i i-11111--o 00ooo0    2
         4 D2S40  
      ---o--0-0- ---0o---0- o--0--o-0- 1--i--    1

    4 ---i--11-- --i-o--0-i 1-1i11i--i 11-ii1    2
      ---i--1-1- -1-1i---1- i--i--i-1- 1--1--    0

    5 ---0--00-- --o-i--1-i i-1110o--o 00ooo0    2
      ---1--1-0- -0-0o---0- o--0--o-1- 1--i--    2

    6 ---o--11-- --i-i--1-o 0-0o-0o--i --ooo1    5
         4 D2S40  30 D2S70  36 ACP1  
      ---o--0-0- -0-0o---0- o--o--o-0- ---i--    1
         34 D2S1_2  

    7 ---0--11-- --i-1--0-o o-0000i--i 11iii0    4
         4 D2S40  36 ACP1  
      ---1--1-1- -1-11---1- i--1--i-1- 1--1--    0

    8 ---1--00-- --o-0--0-o 0-0o011--i 11iii1    2
         4 D2S40  
      ---0--0-0- -0-00---0- o--o--o-0- 0--o--    0

    9 ---1---0-- ----o----o o-1i------ 11-i-1    2
         4 D2S40  
      ---0------ -1-1i---1- i--i------ 0--o--    2
         4 D2S40  

Family 1346   phase likelihood = 0.160, 2d best = 0.160


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---i---i-- ---------- ---------- ----oo    1
      ---o------ ----0o---0 o--------- -i--i1    1

    4 ---o---o-- --i------- --------o- --1-ii    3
         13 D2S43  29 APOB  
      111i----i1 --1-1i---1 i----i--i1 -i1-ii    0

    5 ---i---o-- --o------- --------0- --0-oo    1
         4 D2S40  
      000o----o- --0-0o---0 o----o--00 -o0-oo    0

    6 ---o---o-- --o------- --------0- --0-oo    0
      111i----i- --i-1----1 i----o--00 -o0-oo    1

    7 ---1---o-- --o------- --------0- --0-oo    1
         4 D2S40  
      1111----i1 --i-1i---1 o----o--00 -o0-oo    1

    8 ---0---o-- --i------- --------o- --0-oo    2
         13 D2S43  
      0000----i1 --1-1i---1 i----i--i- --0-oo    2

    9 ---0---o-- --o------- --------o- --0-oo    0
      0000----i1 --i-1i---1 i----i--i1 -i1-i1    1

   10 -------o-- --o------- --------0- --1-oo    2
         33 D2S47  
      000-----o0 --0-0----- -----o--00 -o0-oo    0

Family 1347   phase likelihood = 0.349, 2d best = 0.291


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------1--1 --o-0----- ---1-i--i- 1-1-1i    2
      ------1--1 1-i----0-- ---i--1-i- 0-0-0-    3
         18 D2S45  

    4 ------0--o --o-0----- ---1-i--1- 1-1-1i    1
      ------1--i 1-i----1-- ---i--1-o- 0-0-0-    1

    5 ------0--o --o-0----- ---o-o--0- 0-0-0o    0
      ------1--i 1-i----1-- ---i--1-i- 1-1-1-    0

    6 ---------- ----0----- ---------- 1----i    1
         15 D2S62  
      ---------- 1--------- ---------- 1-----    0

    7 ------1--1 --i-0----- ---1-i--i- 0-0-0o    3
         15 D2S62  
      ------1--1 1-i----1-- ---i--1-i- 1-1-1-    0

    8 ------0--o --o-1----- ---0-o--o- 1-1-1i    3
         15 D2S62  
      ------1--i 1-i----0-- ---o--0-o- 0-0-0-    1

    9 ------0--0 --i-1----- ---i-i--1- 1-1-ii    1
      ------0--0 0-o----0-- ---o--0-o- 1-1-i-    1

   10 ------0--o --o-1----- ---i----1- 1-0-oo    2
      ------1--i 1-i----1-- ---o--0-o- 1-0-o-    3
         31 TPO  

   11 ------0--o --o-1----- ---i----o- 1-1-1i    3
         29 APOB  
      ------1--i 1-i----1-- ---o--0-o- 0-0-0-    1

   16 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1349   phase likelihood = 0.029, 2d best = 0.028


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 oo-----0-- --00-0--00 --1i---1-- 1--11-    1
      oo----0--- 00oi-i--1i i--1------ --00--    2

    4 oo-----1-- --i1-1--11 --1i--00-- ---00-    2
      oo----0--- 00oo-o--0o o--1------ --11--    1

    5 ii-----0-- --11------ ---i---1-- ----0-    3
         8 Prot_C/pcr  35 D2S1  
      ii----1--- 1-ii------ ---1------ --1---    0

    6 oo-----0-- --00-0---0 --0o--00-- ---o0-    0
      oo----0--- 00oo-o---i ---i------ --0o--    2

    7 oo-----0-- --11-1---i --1i---1-- 1--i1-    1
      oo----0--- 11ii-i---i i--1------ --1i--    1

    8 ii-----1-- --11-1--00 --1i---1-- ---00-    3
      ii----1--- 11ii-i--1i i--o------ ---1--    2
         24 D2S6  34 D2S1_2  

    9 00-----0-- --00-0---1 --1i---1-- 0--o0-    2
      11----0--- 00oo-o---o o--o------ --0o--    1

   10 oo-----0-- --01-1---o --0o---1-- ---11-    3
      oo----0--- 00oo-o---o o--0------ --00--    0

Family 1350   phase likelihood = 0.240, 2d best = 0.240


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 oo----000- --o------- -------i-- --1---    1
      oo0--00--- 0-o------- ------oo-- --1-11    1

    4 ii----101- --i--0---o o-0-1--i-- ---0--    5
         8 Prot_C/pcr  34 D2S1_2  
      ii1---1--- 1iii-----i i---i--o-- ----00    1

    5 oo----000- --o--0---1 1-1-1--1-- --00--    2
      oo0--01--1 -iii-----i i---i-i1-- --1-11    1

    6 -------0-- -----1---1 1-1-1----- ---0--    2
         8 Prot_C/pcr  34 D2S1_2  
      -----0---- 1i-i-----i i---i----- -----0    2
         6 LCT  36 ACP1  

    7 ii----000- --o--0---i i-1-i--0-- --00--    3
      000--11--1 1iii-----o o---o-o0-- --0-00    2

    8 -------1-- -----1---i i-1-i----- --00--    1
      -----1---1 1i-i-----o o---o-o--- --1--1    2

    9 ii----111- --i--1---o o-0-o--o-- --00--    1
      000--01--1 1iii-----i i---i-ii-- --1-11    1

Family 1353   phase likelihood = 0.012, 2d best = 0.012


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -1----0-oo --0------- ---------- -----o    1
         2 CRYG1-5_2  
      ------1--- --1------- ---1-11--- -----i    0

    4 -1----0-oo --o------- ---------- -----o    1
         2 CRYG1-5_2  
      ------0--- --o------- ---1-11--- -----i    1

    5 -0----0-oo --o------- ---------- -----i    1
         36 ACP1  
      ------0--- --o------- ---0-00--- -----o    0

    6 -0----1-ii --i------- ---------- -----i    1
         2 CRYG1-5_2  
      ------1--- --i------- ---0-10--- -----o    3
         24 D2S6  26 D2S46  

    7 -0----0-oo --o------- ---------- -----i    1
         36 ACP1  
      ------0--- --o------- ---0-10--- -----o    2
         26 D2S46  

    8 -1----1-ii --o------- ---------- -----0    1
      ------0--- --o------- ---0--0--- -----o    0

    9 -0----1-ii --i------- ---------- -----o    2
         2 CRYG1-5_2  36 ACP1  
      ------1--- --i------- ---1-11--- -----i    0

   10 -0----1-ii --i------- ---------- -----1    1
         2 CRYG1-5_2  
      ------1--- --i------- ---1-11--- -----i    0

   15 -1----0-oo --0------- ---------- -----0    1
         2 CRYG1-5_2  
      ------1--- --1------- ---0-0---- -----o    1

   16 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1354   phase likelihood = 0.404, 2d best = 0.239


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------1--i i--------- ---------- --i--1    0
      i-----1--i i-1------- -----o-0-o --i---    2
         33 D2S47  

    4 ------0--o 0--------- ---------- --0--0    0
      i-----1--i i-1------- -----i-1-i --1---    0

    5 ------1--i i--------- ---------- --o--0    1
      o-----1--i i-1------- -----i-1-i --o---    2
         1 CRYG1-5  33 D2S47  

    6 ------1--i 1--------- ---------- --0--0    1
      i-----1--o o-0------- -----o-0-o --1---    2
         33 D2S47  

    7 ------0--o o--------- ---------- --o--0    0
      o-----0--o o-0------- -----o-0-o --o---    0

    8 ------0--o 0--------- ---------- --0--0    0
      o-----1--i i-1------- -----i-1-i --1---    1
         1 CRYG1-5  

    9 ------1--i 1--------- ---------- --0--0    1
      o-----0--o o-0------- -----i-1-i --1---    1

   10 ------0--o ---------- ---------- --1--1    1
      i-----1--i --0------- -----o-0-o --0---    1

   11 ------0--o i--------- ---------- --o---    2
         11 LCO  33 D2S47  
      o-----1--i i-1------- -----o-0-o --o---    2
         1 CRYG1-5  

   12 ------0--o 0--------- ---------- --1--1    1
      o-----0--o i-1------- -----i-1-o --0---    2

   13 ------0--o o--------- ---------- --i--1    1
      o-----0--o o-0------- -----o-0-i --i---    1

Family 1355   phase likelihood = 0.002, 2d best = 0.002


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- o--------- -----i---i ------    1
         11 LCO  
      ----i----- i------0-- -----o---- ------    1

    4 ---------- o--------- -----o---- ------    0
      ----i----- i------0-- -----o---- ------    1

    5 ---------- i--------- -----i---i ------    0
      ----o----- o------0-- -----o---- ------    0

    6 ---------- o--------- -----i---i ------    1
         11 LCO  
      ----i----- i------0-- -----o---- ------    1

    7 ---------- i--------- -----i---i ------    0
      ----o----- o------0-- -----i---- ------    1
         26 D2S46  

    8 ---------- o--------- -----o---i ------    1
         30 D2S70  
      ----o----- o------0-- -----o---- ------    0

    9 ---------- o--------- -----i---i ------    1
         11 LCO        ----o----- o------0-- -----o---- ------    0

   10 ---------- i--------- -----i---- ------    0
      ----i----- i------0-- -----o---- ------    1

   11 ---------- o--------- -----i---i ------    1
         11 LCO  
      ----i----- i------0-- -----i---- ------    2
         18 D2S45  26 D2S46  

   12 ---------- o--------- -----o---i ------    1
         30 D2S70  
      ----i----- i------0-- -----o---- ------    1

   13 ---------- o--------- ---------- ------    0
      ----i----- i------1-- ---------- ------    0

   14 ---------- i--------- ---------- ------    0
      ----o----- o------0-- ---------- ------    0

   17 ---------- i--------- ---------- ------    0
      ----o----- o------0-- ---------- ------    0

   18 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1356   phase likelihood = 0.507, 2d best = 0.493


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------1-11 ---------- ---1---i-- ------    0
      ------0--- ---------- ---------- --o---    0

    4 ------0-00 ---------- ---1---i-- ------    1
      ------0--- ---------- ---------- --o---    0

    5 ------0-00 ---------- ---1---o-- ------    2
         24 D2S6  28 APOB_2  
      ------1--- ---------- ---------- --o---    1
         7 D2S44  33 D2S47  

    6 ------1-11 ---------- ---1---o-- ------    1
         28 APOB_2  
      ------0--- ---------- ---------- --o---    0

    7 ------1-11 ---------- ---1---i-- ------    0
      ------1--- ---------- ---------- --o---    1
         7 D2S44  33 D2S47  

    8 --------00 ---------- ---0---o-- ------    0
      ---------- ---------- ---------- --i---    0

    9 ------0-11 ---------- ---0---o-- ------    2
         7 D2S44  
      ------1--- ---------- ---------- --o---    1
         7 D2S44  33 D2S47  

   10 ------0-00 ---------- ---1---i-- ------    1
      ------1--- ---------- ---------- --i---    0

   11 ------1-00 ---------- ---1---i-- ------    2
         7 D2S44  
      ------1--- ---------- ---------- --i---    0

   15 ------1-11 ---------- ---1---i-- ------    0
      ------1--- ---------- ---------- --i---    0

   16 ------1-11 ---------- ---1---i-- ------    0
      ------0--- ---------- ---------- --i---    1
         7 D2S44  33 D2S47  

   17 ------1-11 ---------- ---1---i-- ------    0
      ------0--- ---------- ---------- --i---    1
         7 D2S44  33 D2S47  

Family 1357   phase likelihood = 0.126, 2d best = 0.080


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------o o-o----i-- -----1---- -----i    1
      ii-------- i-i----1-- ---i---i-- --0--o    1

    4 ---------i i-i----i-- -----0---- -----i    2
         26 D2S46  36 ACP1  
      oo-------- o-i----1-- ---i---i-- --0--o    2

    5 ---------i i-i----i-- -----1---- -----i    0
      oo-------- o-o----o-- ---o---i-- --1--i    1

    6 ---------o o-o----o-- -----1---- -----o    2
         26 D2S46  36 ACP1  
      ii-------- i-i----i-- ---i---i-- --1--i    0

    7 ---------i 0-o----o-- -----0---- -----i    2
         10 D2S54_2  36 ACP1  
      oo-------- o-o----0-- ---o---o-- --0--o    0

    8 ---------o 0-o----i-- ---------- -----i    1
      oo-------- o-o----o-- ---o---o-- --0--o    0

    9 ---------o o-o----o-- ---------- -----i    1
         36 ACP1  
      ii-------- i-i----i-- ---i---i-- --1--i    0

   10 ---------o 0-i----i-- ---------- -----o    2
         36 ACP1  
      ii-------- o-o----o-- ---o---i-- --1--i    2

   11 ---------o 0-o----i-- -----0---- -----o    2
         18 D2S45  
      oo-------- o-o----1-- ---i---i-- --1--i    1

   12 ---------o o-o----o-- -----0---- -----o    0
      ii-------- i-o----0-- ---o---o-- --0--o    1

   13 ---------i --o----i-- -----0---- -----o    3
         10 D2S54_2  13 D2S43  18 D2S45  
      oo-------- --i----1-- ---i---i-- --1--i    1

   14 ---------i i-i----i-- -----0---- -----o    1
      oo-------- o-o----o-- ---o---i-- --1--i    1

   17 ---------o --i----i-- -----1---- -----o    2
         10 D2S54_2  36 ACP1  
      oo-------- --o----o-- ---i---i-- --0--o    2

   18 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1358   phase likelihood = 0.225, 2d best = 0.200


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- ---------- ---o---0-- -----0    0
      --------o- ---------- ---o--00-- ------    0

    4 ---------- ---------- ---i---0-- -----1    2
         24 D2S6  28 APOB_2  36 ACP1  
      --------o- ---------- ---i--00-- ------    2
         9 D2S54  24 D2S6  

    5 ---------- ---------- ---i---1-- -----0    1
         36 ACP1  
      --------i- ---------- ---i--11-- ------    0

    6 ---------- ---------- ---i---1-- -----0    1
         36 ACP1  
      --------o- ---------- ---o--01-- ------    1
         28 APOB_2  

    7 ---------- ---------- ---o---o-- -----1    1
         36 ACP1  
      --------i- ---------- ---o--1i-- ------    2
         9 D2S54  24 D2S6  

    8 ---------- ---------- ---i---i-- -----1    0
      ---------- ---------- ---o--0o-- ------    0

    9 ---------- ---------- -------0-- -----1    1
         28 APOB_2  36 ACP1  
      --------o- ---------- ------00-- ------    0

   10 ---------- ---------- ---------- -----0    0
      --------i- ---------- ------0--- ------    1
         9 D2S54  27 D2S48  

   15 ---------- ---------- -------i-- -----1    0
      --------i- ---------- ------0o-- ------    1
         9 D2S54  

Family 1359   phase likelihood = 0.017, 2d best = 0.014


    3 iii-i-i-i- --o------- ---------- ------    1
         13 D2S43  
      iii---i--- o--------- ---------- --o--o    1

    4 iii-i-i-i- --i------- ---------- ------    0
      ooo---i--- i--------- ---------- --i--i    1

    5 iii-i-o-i- --i------- ---------- ------    2
         7 D2S44  
      ooo---o--- i--------- ---------- --i--i    1

    6 iii-i-i-i- --i------- ---------- ------    0
      iii---i--- o--------- ---------- --i--o    3
         11 LCO  33 D2S47  36 ACP1  

    7 ooo-o-o-o- --o------- ---------- ------    0
      ooo---i--- i--------- ---------- --i--i    1

    8 iii-i-i-i- --i------- ---------- ------    0
      iii---i--- ---------- ---------- --i--i    0

    9 ooo-o-i-i- --i------- ---------- ------    1
      iii---o--- o--------- ---------- --i--i    2

   10 iii-i-o-o- --o------- ---------- ------    1
      iii---i--- o--------- ---------- --i--i    2
         11 LCO  

   11 ooo-o-i-i- --i------- ---------- ------    1
      ooo---o--- o--------- ---------- --o--o    0

   12 iii-i-o-o- --o------- ---------- ------    1
      ooo---i--- ---------- ---------- --i--i    1

   13 iii-i-o-o- --o------- ---------- ------    1
      ooo---o--- o--------- ---------- --o--o    0

   14 iii-i-i-i- --i------- ---------- ------    0
      iii---i--- i--------- ---------- --o--o    1

   15 ooo-i-i-i- --i------- ---------- ------    1
      iii---i--- o--------- ---------- --o--o    1

   16 iii-i-i-i- --i------- ---------- ------    0
      iii---i--- i--------- ---------- --i--i    0

   17 iii-i-i-i- --i------- ---------- ------    0
      iii---i--- i--------- ---------- --i--i    0

   18 ooo-i-i-i- --i------- ---------- ------    1
      iii---i--- i--------- ---------- --o--o    1

Family 1362   phase likelihood = 0.168, 2d best = 0.085


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 000----0-- o-o--11-1- i-1o-o0o-- -i1---    3
      111i---i-- -o--000-00 o---oo0o-- 1ii-1-    2

    4 000----i-- i-i------- ---o-oo0-o -00---    2
      111----i-- ----1----- -----iii-- -1i---    0

    5 iii----0-- o-o--ii-1- i-1i-i1i-i -11---    2
      iiii---i-- -i--1ii-11 i---ii1i-- 00o-0-    1

    6 000----0-- o-o--00-1- i-1i-ii1-i -i1---    1
      111i---i-- -i--111-00 o---oooo-- 1ii-1-    2

    7 111----0-- i-i--ii-1- o-0o-o0--o --1---    4
         8 Prot_C/pcr  33 D2S47  
      000o---i-- -i--1ii-10 o---oo0--- 1-i-1-    3

    8 iii----i-- i-i--ii-1- i-0o-o-o-o -00---    1
      iiii---i-- -i--1ii-11 i---oo-o-- 11i-1-    2

    9 iii----i-- i-o--ii-1- i-1i-i1i-i -00---    3
         13 D2S43  
      iiii---i-- -i--1iii11 i---ii1i-- 11i-1-    0

   10 iii----0-- o-o--00-0- o-0o-ii1-i -11---    2
      iiii---i-- -i--111i11 i---oooo-- 00o-0-    1

   11 iii----0-- --o--00-0- o-0o-i1i-i -00---    3
      iiii---i-- -i--111i11 i---ii1i-- 11i-1-    0

   12 111----i-- i-i--11-0- o-0o-oo0-- --0---    1
      000i---i-- -i--000o00 o---iiii-- 1-i-1-    3

   17 111----1-- --i--11-1- i-1i-i1i-i -o0---    1
      000o---o-- -o--000o01 i---ii1i-- 0oo-0-    2


Family 1375   phase likelihood = 0.586, 2d best = 0.094


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 1i----1i-- i-1------- -----111-- 1-----    0
      -o--0--o-- o------i-- -------0-- ------    2
         18 D2S45  28 APOB_2  

    4 0o----0o-- 0-0------- -----00o-- 0-----    0
      -i--1--i-- 0------o-- -------o-- ------    1

    5 11----11-- i-1------- -----000-- ------    1
      -i--1--i-- o------o-- -------1-- ------    2
         28 APOB_2  

    6 1i----11-- i-1------- -----111-- 0-----    1
         31 TPO  
      -o--1--i-- o------o-- -------0-- ------    2
         2 CRYG1-5_2  

    7 1i----00-- 0-0------- -----00o-- 1-----    2
         31 TPO  
      -o--0--o-- 0------o-- -------o-- ------    0

    8 00----00-- 0-0------- -----00o-- 0-----    0
      -o--0--o-- 0------i-- -------o-- ------    2
         18 D2S45  28 APOB_2  

   13 0o----0o-- 0-0------- -----00--- 0-----    0
      -i--1--i-- 0------o-- ---------- ------    1

Family 1377   phase likelihood = 0.495, 2d best = 0.253


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -1----1-ii ---------- -----o---0 --0---    1
      000---1-ii -------i-- ---i-11--- ------    1

    4 -o----0ooo ---------- -----i---0 0-0---    2
         26 D2S46  
      0o0---0ooo ----o--o-- ---i-i1--- 1-----    1

    5 -0----000o ---------- -----o---0 0-0---    0
      111---1111 -------o-- ---o-o0--- 0-----    1

    6 -1----111i --i------- -----i---1 0-0---    1
      000---0000 ----i--i-- ---i-i1--- 1-----    1

    7 -o----0ooo --i------- -----i---0 0-0---    2
      0o0---0ooo -------o-- ---o-00--- 1-----    1
         31 TPO  

    8 -0----000o ---------- -----i---1 0-1---    3
         31 TPO  33 D2S47  
      111---1111 -------i-- ---o-0---- 0-----    1

    9 -i----1-1i --i------- -----i---0 0-1---    2
         33 D2S47  
      1i1---0-00 ----o--o-- ---o-00--- 0-----    1

   14 -o----000o ---------- -----o---1 1-1---    1
      0o0---1111 ----o--o-- ---i-11--- 1-----    3

Family 1408   phase likelihood = 0.392, 2d best = 0.230


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------00-0 0-o----o-- ---1-i1--- -o--00    2
      111---0--- ---------- ---1-i---- -i1---    2
         7 D2S44  

    4 -------1-- 1--------- ---------- -0---0    1
      ---------- ---------- ---------- -0----    0

    5 ------11-1 1-i----o-- ---0-o0--- -i--11    2
      111---1--- ---------- ---0-o---- -o0---    1

    6 ------11-1 1-i----i-- ---i-11--- -0--00    1
      000---1--- ---------- ---o-0---- -00---    2
         7 D2S44  

    7 ------11-1 0-o----o-- ---0-o0--- -0--00    1
      000---0--- ---------- ---0-o---- -00---    0

    8 ------00-0 0-o----o-- ---o-i1--- -o--00    2
      000---0--- ---------- ---i-i---- -i1---    1

    9 ------11-1 1-o----o-- ---o-i1--- -o--00    3
      111---1--- ---------- ---i-i---- -i1---    0

   14 ------11-1 1-o----o-- ---0-o0--- -i---1    2
      111---1--- ---------- ---0-o---- -o0---    1

Family 1413   phase likelihood = 0.222, 2d best = 0.222


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---o--0o-- -o-0--i1i- 00-11-i--i -i11--    3
      ---0--0o-- 0--o--0-o- ---0--o--- -o0---    0

    4 ---o--00-- -o-0o-o0o- 11-11-o--o -o00--    2
      ---ii-11-- 1--ii-1-i- ---0--o--- -o0---    1

    5 ------1i-- -i-0o-o0o- 00-11-i--i -o0---    3
      ----i-1i-- 1--ii-1-i- ---0--o--- -i1-i-    2

    6 ---o--0o-- -o-0o-o0o- 00-o0-o--o -o00--    0
      ---0--0o-- 0--oo-0-o- ---o--o--- -o0---    0

    7 ------0o-- ----o--0-- ---o--i--i -o0---    2
      ------0o-- 0---o----- ---o--o--- -i1-i-    1

    8 ------00-- -o-0o-o1i- 11-i1-i--i -i11--    1
      ----i-11-- 1--ii-1-i- ---i--i--- -o0---    1

    9 ------1i-- ------o1i- 11-i1-i--i -i11--    2
         17 D2S38  
      ----i-1i-- 1-----1-i- ---i--i--- -o0---    1

   10 ------11-- -i-0o-o0o- 00-i1-i--i --11--    2
      ------00-- 0--oo-0-o- ---i--i--- --1-i-    1

   11 ---i--1i-- -i-1i-i1o- 00-o0-o--o -i11--    2
      ---1i-1i-- 1--ii-1-i- ---o--o--- -o0---    1

   12 ---i--11-- -i-1o-o0o- 00-00-o--o -i11--    2
      ---o--00-- 0--oo-0-i- ---1--i--- -o0---    2

   13 ---i--1i-- -i-1i-i1i- 11-i1-i--i -i11--    0
      ---1i-1i-- 1--ii-1-i- ---i--i--- -o0---    1

   14 ---o--0o-- -i-1i-i1o- 00-11-i--o -o00--    4
      ---0--0o-- 0--oo-0-o- ---0--o--- -o0---    0

   15 ---o--0o-- -o-0o-o0-- -0-00-o--o -i11--    1
      ---i--0o-- 0--ii-1--- ---1--i--- -i1-i-    2
         4 D2S40  

   16 ---i--1i-- -i-1i--1i- 11-00-o--o -o00--    1
      ---1i-1i-- 1--ii---i- ---1--i--- -i1-i-    0

   17 ---i--0o-- -o-0o-o0o- 00-o0-i--i -i11--    2
         4 D2S40  
      ---1--0o-- 0--oo-0-o- ---o--o--- -o0---    1
         4 D2S40  

Family 1416   phase likelihood = 0.881, 2d best = 0.060


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 --1---0-0o 0000o--o0- ---00000-- -0000-    1
         3 CRYG1-5_3  
      ---i--11-i -1-----o-o ---------- --0-00    1

    4 --1---0-0o 0001i--i1- i--11-11-- -1-1i-    2
         3 CRYG1-5_3  
      ---i--11-i -1-----i-i i--------- ----o0    1

    5 --0---0-1i -111i--11- 1--1--11-- -0000-    2
      ---o--00-o -0-----0-o 0--------- --0-00    0

    6 --0---0-0o 0o00o--11- ---00100-- -1111-    5
         26 D2S46  
      ---o--00-0 -o-----0-o ---------- --1-11    1

    7 --0---1-1i 1110o--11- 1--00000-- -0000-    4
         3 CRYG1-5_3  
      ---i--10-o -0-----0-o 0--------- --0-00    1

    8 --1---0-0o 0011---i-- ---1-110-- -11-i-    4
         3 CRYG1-5_3  28 APOB_2  
      ------11-i -1-----i-i ---------- --0-o0    1

    9 --1---1-1i 1111i--11- 1--11111-- -111i-    0
      ---i--00-o -0-----0-o 0--------- --0-o0    1
         4 D2S40  

   10 --1---0-1i 1i10o--i1- ---11111-- --000-    5
         3 CRYG1-5_3  7 D2S44  
      ---o--11-1 -i-----i-i ---------- --0-00    2
         4 D2S40  

   15 --1---0-0o 0-0-o--0-- ---0-1-1-- -00---    3
         3 CRYG1-5_3  
      ------00-0 -------1-- ---------- --0---    2
         18 D2S45  33 D2S47  

   16 ---------- ---------- ---------- ------    0
      -------0-- ---------- ---------- ------    0

Family 1418   phase likelihood = 0.313, 2d best = 0.313


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ooo-1--1-- --i11----- 1-1i1i---- --0---    2
         33 D2S47  
      ii--11---- --i1------ -----i1--- --o---    1
         33 D2S47  

    4 iii-1--1-- --1i1----- 1-1i0o---- --0---    1
      11--00---- --0o------ -----11--- --i---    2

    5 ooo-1--1-- --1i1----- 0-0o0o---- --1---    3
         33 D2S47  
      00--00---- --0o------ -----11--- --i---    1

    6 iii-0--0-- --0o------ 1-1o0o---- --1---    4
         33 D2S47  
      11--11---- --1i------ -----11--- --o---    1
         33 D2S47  

    7 ooo-0--0-- --o0------ 0-0i1i---- --1---    1
      00--00---- --o0------ -----00--- --o---    0

    8 ooo-0--1-- --o00----- 1-1i1o---- --1---    5
         8 Prot_C/pcr  26 D2S46  33 D2S47  
      00--00---- --o0------ -----11--- --i---    1

    9 ooo-1--1-- --1i1----- 1-1o0o---- --0---    2
      00--00---- --0o------ -----o0--- --i---    1
         33 D2S47  

   10 iii-1--1-- --1i1----- 1-1i1i---- --0---    1
         33 D2S47  
      11--01---- --0o------ -----00--- --o---    3
         5 D2S51  6 LCT  

Family 1420   phase likelihood = 0.327, 2d best = 0.103


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ----1i1--i 1-1----i-- ---1-i---- 0-----    1
         31 TPO  
      -----o00-o ----0--o-- -----o---- 1---i1    1

    4 ----0o0--o 0-0----0-- ---1-i---- 1-----    1
      -----o00-o ----0--0-- -----o---- 0---o0    0

    5 -----i---- 1--------- ---------- 1-----    0
      -----i-1-- ----1----- ---------- 0----0    1

    6 ----0o0--o 0-0----o-- ---0-i---- 0-----    2
         26 D2S46  31 TPO  
      -----i11-i ----1--i-- -----i---- 0---o0    1

    7 ----0o0--o 0-0----o-- ---0-o---- 1-----    1
         31 TPO  
      -----i11-i ----1--i-- -----o---- 1---i1    2
         26 D2S46  

    8 ----1i1--i 1-0----0-- ---0-o---- 0-----    1
      -----i00-o ----0--0-- -----i---- 1---i1    2
         6 LCT  

   13 ----0o0--o 0-0----o-- ---1-i---- 0-----    2
         31 TPO  
      -----i11-i ----1--i-- -----i---- 1----1    0

Family 1421   phase likelihood = 0.009, 2d best = 0.009


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 iiio--00-- -o-o--o-i- -i-ooo---- 00---0    3
      oooo--1111 --1ii-i-10 ---0o----- ----o-    2

    4 000o--11-- -i-i--i--- -o-o0o---- 11---1    3
      000o--0000 --11i-1--1 ---i1----- ----i-    1

    5 000i--1i-- ---i--i-i- -i-iii---- -0---0    2
      0000--1i11 --11--1-11 ---1i----- ----o-    2
         35 D2S1  

    6 oooo--00-- ---o--o-o- -o-ooo---- 11---1    1
      iiio--1111 --00--0-00 ---0o----- ----o-    3
         4 D2S40  

    7 oooo--0o-- -o-i--o-o- -o-ooo---- 11---1    3
         14 D2S25  
      iii1--1o00 --0oo-0-00 ---0o----- ----o-    1

    8 ---i---1-- -i-i--o-o- -o-i1----- 00---0    3
      ---0---0-- ---oo-0-00 ---o0----- ----o-    0

   11 iiii--11-- -o-o--o-o- ---iii---- 11---1    2
      ooo0--0000 --00o-0-00 ---oi----- ----i-    1

   12 oooo--1i-- -i-o--o--- -o-iii---- -0---0    4
      iii1--1i11 --1ii-i--1 ---1i----- ----i-    0

Family 1423   phase likelihood = 0.027, 2d best = 0.027


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -------0-- ----0----- ---o------ -00--o    0
      ----1--1-1 ----1----- ---i---1-- --i---    0

    4 -------o-- ----1----- ---0------ -00--o    2
         8 Prot_C/pcr  15 D2S62  
      ----0--o-- ----0----- ---o-----0 --o---    0

    5 -------1-- ----1----- ---1------ -11--i    0
      ----0--0-- ----0----- ---i---1-- --i---    1

    6 -------1-- ----o----- ---0------ -11--i    2
         8 Prot_C/pcr  
      ----0--0-- ----o----- ---o-----0 --o---    0

    7 -------1-- ----o----- ---i------ -11--i    2
         8 Prot_C/pcr  15 D2S62  
      ----0--0-- ----o----- ---o-----0 --o---    0

    8 -------o-- ----1----- ---o------ -00--o    2
         8 Prot_C/pcr  15 D2S62  
      ----0--o-- ----0----- ---i---1-- --i---    1

    9 -------0-- ----i----- ---i------ -11--i    1
         8 Prot_C/pcr  
      ----1--1-1 ----i----- ---o-----0 --o---    1

   10 -------0-- ----o----- ---0------ -00--o    0
      ----1--1-1 ----o----- ---o-----0 --o---    1

   15 -------i-- ---------- ---------- ------    0
      -------i-- ---------- ---------- ------    0

Family 1424   phase likelihood = 0.327, 2d best = 0.098


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ii----1i1- ---------- -----i---1 ------    0
      oo0--11--- 1------1-- -----o---- ----0-    2

    4 oo----0o0o --0------- -----o---0 ------    0
      ii1--11--- 1------1-- -----i---- ----0-    1
         35 D2S1  

    5 oo----0o0o --0------- -----i---1 ------    1
      ii1--00--- 0------1-- -----i---- ----0-    3
         35 D2S1  

    6 oo----0o0o --0------- -----i---1 ------    1
      ii1--11--- 1------1-- -----i---- ----0-    1
         35 D2S1  

    7 ii----1i1- ---------- -----i---1 ------    0
      oo0--11--- 1------1-- -----i---- ----1-    1

    8 oo----1i1- ---------- -----o---0 ------    2
      ii1--00--- 0------0-- -----i---- ----0-    3
         26 D2S46  35 D2S1  

    9 11----1i1- ---------- -----i1--1 ------    0
      111--11--- 1------1-- -----i---- ----1-    0

   10 00----1i1- ---------- ------0--0 ------    2
      000--00--- 0------0-- ---------- ----0-    0

Family 66   phase likelihood = 0.038, 2d best = 0.036


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 iii--1-11- --1------- ---i-i---i ------    0
      ooo------- ----1----- ---o------ 0-0---    2
         15 D2S62  

    4 iii--1-11- --1------- ---1-i---o ------    1
         30 D2S70  
      ooo------- ----1----- -0-1------ 0-0---    4
         15 D2S62  22 D2S5  24 D2S6  

    5 iii--1-11- --1------- ---o-o---o ------    1
      ooo------- ----1----- ---i------ 1-1---    1

    6 iii--1-11- --1------- ---1-i---i ------    0
      ooo------- ----0----- -1-1------ 1-1---    1

    7 111----11- --1------- ---i-i---o ------    1
         30 D2S70  
      111------- ----0----- -1-o------ --0---    3
         15 D2S62  22 D2S5  

    8 000--0-00- --0------- ---o-i---i ------    1
      000------- ----0----- -1-i------ 1-1---    1

    9 111--0-00- --1------- ---0-o---o ------    3
         13 D2S43  
      111------- ----0----- ---0------ 0-0---    1

Family 12   phase likelihood = 0.859, 2d best = 0.131


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 00----1--1 -o0------- ---------- i11---    3
      1ii---11-- --1------- -----1---1 i1----    0

    4 ---------- -i-------- ---------- 00----    1
         12 D2S41  
      -------1-- ---------- ---------1 11----    0

    5 00----0--0 -o0------- ---------- o00---    0
      1ii---11-- --1------- -----1---1 o0----    1

    6 00----0--0 -o0------- ---------- o00---    0
      1ii---11-- --1------- -----0---0 o0----    1

    7 11----0--0 -oo------- ---------- 000---    1
      0oo---11-- --o------- -----0---0 11----    3

    8 ii----1--1 -ii------- ---------- 000---    1
      iii---11-- --i------- -----1---1 11----    0

    9 oo----0--0 -oo------- ---------- 111---    1
      ooo---00-- --o------- -----0---0 00----    0

Family 23   phase likelihood = 0.225, 2d best = 0.108


    3 ------i-ii --i----i-- -i-i--o--- --o---    1
      oo----o--i --o------- -o-------- ------    2
         10 D2S54_2  

    4 ------o-oo --o----o-- -o-i--i--- --i---    1
      oo----i--i --i------- -i-------- ------    1

    5 ------i-ii --i----o-- -o-o--o--- --o---    1
      oo----o--i --i------- -i-------- ------    1

    6 ------o-oo --o----o-- -o-o--i--- --o---    2
         27 D2S48  33 D2S47  
      ii----i--i --i------- -i-------- ------    0

    7 ------o-oo --o----o-- ---o--o--- --i---    1
         33 D2S47  
      oo----o--o --o------- ---------- ------    0

    8 ------o-oo --o----o-- ---o--o--- --o---    0
      ii----i--i --i------- ---------- ------    0

Family 21   phase likelihood = 0.143, 2d best = 0.132


    3 -------i-- ---------- ---i-ii--- ------    0
      ---------- ---------- -----i---- -i----    0

    4 -------o-- ---------- -o-i-i---- o-----    2
         31 TPO  
      ---------- ---------- -----i---- -o----    1
         26 D2S46  32 TPO_2  

    5 -------o-- ---------- -o---oo--- i-----    1
         31 TPO  
      ---------- ---------- -----o---- -i----    1
         26 D2S46  32 TPO_2  

    6 -------i-- ---------- -i-i-ii--- i-----    0
      ---------- ---------- -----i---- -i----    0

    7 -------o-- ---------- ---i-ii--- i-----    1
         8 Prot_C/pcr  
      ---------- ---------- -----o---- -o----    0

    8 -------o-- ---------- -----ii--- ------    1
         8 Prot_C/pcr  
      ---------- ---------- -----o---- ------    0

    9 ---------- ---------- ------i--- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 2   phase likelihood = 0.064, 2d best = 0.047


    3 -----oo--o --o------- -------i-o -oo---    2
         28 APOB_2  
      oo---oo--o --o------- ---o-ii--o --o---    2

    4 ------i--i --i------- -------i-i -ii---    0
      oo----o--o --o------- ---i-ii--i --i---    1

    5 -----ii--i --i------- -------i-i -ii---    0
      oo---oi--i --i------- ---i-ii--i --o---    2
         33 D2S47  

    6 ---------- ---------- ---------- -o----    0
      ---------- ---------- ------i--- ------    0

    7 -----oo--o --o------- ---------o -oo---    0
      ii---ii--i --i------- ---i-ii--o --o---    1

    8 -----oo--o --o------- ---------o -oo---    0
      oo---oo--o --o------- ---o-ii--i --i---    1

    9 -----ii--i --i------- -------o-o -oo---    1
      oo---ii--i --i------- ---o--i--i --o---    4
         24 D2S6  33 D2S47  

Family 17   phase likelihood = 0.001, 2d best = 0.001


    3 -----o-o-- --o------- ---------- -i----    1
         32 TPO_2  
      -----i--i- --i------- ---------- -ii---    0

    4 -----o-o-- --o------- ---------- -o----    0
      -----i--i- --i------- ---------- -i----    0

    5 -----i-i-- --o------- ---------- -o----    1
      -----i--i- --i------- ---------- -i----    0

    6 -----o-o-- --o------- ---------- -i----    1
         32 TPO_2  
      -----i--o- --o------- ---------- -o----    1
         6 LCT  

    7 -----i-i-- ---------- ---------- -i----    0
      -----i---- ---------- ---------- -i----    0

    8 -------i-- --i------- ---------- -i----    0
      ---------- --o------- ---------- -o----    0

    9 -------i-- --i------- ---------o -o----    1
      --------o- --o------- ---------- -i----    1
         32 TPO_2  

   10 -----o-i-- --i------- ---------i -i----    1
         6 LCT  
      -----o--o- --o------- ---------- -o----    0

Family 37   phase likelihood = 0.215, 2d best = 0.160


    3 ------ii-- --i-i----- -----o-o-- o-----    1
      ------oo-- -------o-- -----o---- ii----    1

    4 ------oo-- --o-o----- -----i---- i-----    1
      ------ii-- -------i-- -----i---- ii----    0

    5 ------oi-- --i-i----- -----i---- i-----    1
         7 D2S44  
      ------oo-- -------o-- -----i---i oo----    2

    6 ------ii-- --o-o----- -----o-o-- o-----    1
      ------ii-- -------i-- -----i---i ii----    0

    7 ------oo-- --o------- -----o-o-- ------    0
      ------ii-- -------i-- -----i---i ------    0

    8 ------i--- --i-i----- -----i-i-- o-----    1
         31 TPO  
      ------i--- -------i-- -----i---o oo----    1

    9 ------oo-- --o-o----- -----i-i-- o-----    2
         31 TPO  
      ------ii-- -------i-- -----i---i ii----    0

Family 35   phase likelihood = 0.145, 2d best = 0.123


    3 -----o-o-- ---------- ------o--- -i----    1
         32 TPO_2  
      -----o-o-- ---------- ---------- ------    0

    4 -----i-o-- ---------- ------o--- -o----    1
         6 LCT  
      -----i-i-- ---------- ---------- ------    0

    5 -----o-o-- ---------- ------o--- -o----    0
      -----o-o-- ---------- ---------- ------    0

    6 -----i-i-- ---------- ------i--- -i----    0
      -----i-o-- ---------- ---------- ------    1
         6 LCT  8 Prot_C/pcr  

    7 -----i-i-- ---------- ------i--- ------    0
      -----i-i-- ---------- ---------- ------    0

    8 -----i-i-- ---------- ------i--- -o----    1
         32 TPO_2  
      -----i-i-- ---------- ---------- ------    0

    9 -----i-i-- ---------- ------i--- -i----    0
      -----o-o-- ---------- ---------- ------    0

   10 -----i-i-- ---------- ------i--- -i----    0
      -----o-o-- ---------- ---------- ------    0

Family 28   phase likelihood = 0.030, 2d best = 0.030


    3 ooo-i----i --i------- -----ii--- ------    1
      -i----oo-- --o------- -----io--- ------    3
         2 CRYG1-5_2  26 D2S46  27 D2S48  

    4 iii-i----i --i------- -----io--- ------    1
         27 D2S48  
      -i---iii-- --i------- -----ii--- ------    0

    5 iii-i----i --i------- -----oo--- ------    1
      -i---iio-- --o------- -----oo--- ------    1

    6 ooo-o----- --o------- -----oo--- ------    0
      -o---iii-- --i------- -----ii--- ------    1
         2 CRYG1-5_2  

    7 ---------- ---------- ------o--- ------    0
      -------o-- ---------- ------i--- ------    1
         8 Prot_C/pcr  27 D2S48  

    8 iii-i----i --i------- -----ii--- ------    0
      -o---iii-- --o------- -----oo--- ------    2
         2 CRYG1-5_2  

    9 ooo-i----- --i------- -----io--- ------    2
         27 D2S48  
      -i---iio-- --o------- -----oo--- ------    1

Family 45   phase likelihood = 0.043, 2d best = 0.041


    3 i-i-iiii-- -------i-- ---o------ --o---    1
      -i---iiii- ----i----- ---i------ --i---    0

    4 i-i-oooo-- -------i-- ---i------ --o---    3
         33 D2S47  
      -i---oooo- ----i----- ---o-o---- --i---    4
         2 CRYG1-5_2  15 D2S62  33 D2S47  

    5 o-o-iiii-- -------i-- ---i------ ------    1
      -----oooo- ----o----- ---o-o---- ------    0

    6 o-o-oooo-- -------o-- ---------- --i---    1
         33 D2S47  
      -----oooo- ----o----- ---------- --i---    1
         33 D2S47  

    7 i-i-iiii-- -------o-- ---------- --i---    2
         18 D2S45  33 D2S47  
      -i---iii-- ----i----- ---------- --o---    1
         33 D2S47  

    8 o-o-oooo-- -------o-- ---o------ --o---    0
      -----oooo- ----o----- ---o-o---- --o---    0

    9 -----o-o-- ---------- ---------- ------    0
      -----i-o-- ----o----- ---------- ------    1
         6 LCT  

   10 -----o-o-- ---------- ---------- ------    0
      -----o-o-- ----o----- ---------- ------    0

Family 884   phase likelihood = 0.382, 2d best = 0.128


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -----1---- -i--111-ii --1--0---- o--0--    1
      ---------- ---1-11-1i --11i1---- 1-----    0

    4 -----1---- -i--111-o- --0--0---- i-----    2
         31 TPO  
      ---------- ---1-11-1- --11i1---- 1-----    0

    5 -----1---- -i--111-io --0--o---- o--0--    1
      ---------- ---0-00-0o --00oo---- 0-----    0

    6 -----0---- -i--111-ii --1--0---- o--0--    2
         6 LCT  
      ---------- ---1-11-1i --11i1---- 0-----    1
         31 TPO  

    7 -----1---- -i--111-oo --0--o---- o--0--    1
      ---------- ---0-00-0o --00oo---- 1-----    1
         31 TPO  

    8 -----0---- -o--000-oo --0--1---- o--0--    2
         26 D2S46  
      ---------- ---1-00-0o --00o0---- 1-----    2
         14 D2S25  31 TPO  

    9 -----0---- -o--111-ii --1--o---- i--1--    3
         26 D2S46  
      ---------- ---0-00-0o --00oo---- 0-----    0

   10 -----0---- -i--000-oo --0--o---- o--0--    2
         6 LCT  12 D2S41  
      ---------- ---0-00-0o --00oo---- 1-----    1
         31 TPO  

   11 ---------- -o--000-ii --1--o---- o--0--    2
      ---------- ---0-00-0o --00oo---- 1-----    1
         31 TPO  

   12 -----0---- -o--000-oo --0--0---- i--1--    1
      ---------- ---1-11-1i --11i1---- 1-----    0

   13 -----1---- -i--111-ii --1--0---- o--0--    1
      ---------- -----11-1i --11i1---- 1-----    0

   14 -----0---- -o--000-ii --1--o---- o--0--    2
      ---------- ---0-00-0o --00oo---- 1-----    1
         31 TPO  

Family 102   phase likelihood = 0.001, 2d best = 0.001


    3 -------i-o ---------- ---i--i--- o-----    3
         8 Prot_C/pcr  10 D2S54_2  31 TPO  
      -------o-- ---------- ------o--- o-----    0

    4 -------i-i ---------- ---o------ o-----    1
      -------i-- ---------- ---------- i-----    0

    5 -------o-o ---------- ---i--i--- i-----    1
      -------o-- ---------- ------i--- i-----    1
         8 Prot_C/pcr  

    6 -------o-o ---------- ---o--i--- i-----    1
      -------i-- ---------- ------o--- o-----    1
         8 Prot_C/pcr  

    7 -------i-i ---------- ---i--i--- i-----    0
      -------o-- ---------- ------i--- o-----    2
         8 Prot_C/pcr  27 D2S48  31 TPO  

    8 -------o-o ---------- ---o--o--- o-----    0
      -------o-- ---------- ------o--- i-----    1
         31 TPO  

    9 -------o-- ---------- ------i--- i-----    1
         8 Prot_C/pcr  
      -------i-- ---------- ------i--- i-----    0

   10 -------o-i ---------- ---o--o--- o-----    2
         8 Prot_C/pcr  10 D2S54_2  
      -------i-- ---------- ------i--- o-----    1
         31 TPO  

   11 -------o-i ---------- ---i--i--- ------    1
         8 Prot_C/pcr  
      -------i-- ---------- ------i--- ------    0

   12 -------i-o ---------- ---i--i--- o-----    3
         8 Prot_C/pcr  10 D2S54_2  31 TPO  
      -------o-- ---------- ------o--- o-----    0

   13 -------i-i ---------- ---o--i--- o-----    3
         24 D2S6  27 D2S48  31 TPO  
      -------o-- ---------- ------o--- o-----    0

   14 -------o-o ---------- ---o--o--- o-----    0
      -------i-- ---------- ------o--- o-----    1
         8 Prot_C/pcr  

   15 -------i-i ---------- ---i--i--- i-----    0
      -------i-- ---------- ------i--- i-----    0

   16 -------o-o ---------- ---o--o--- o-----    0
      -------o-- ---------- ------o--- i-----    1
         31 TPO  

Family 104   phase likelihood = 0.006, 2d best = 0.006


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 -----o-i-- ---------- ---1------ ------    1
         6 LCT  
      -----i-1-- ---------- ---------- ------    0

    4 -----o-o-- ---------- ---0------ ------    0
      -----i-i-- ---------- ---------- 0-----    1
         31 TPO  

    5 -----o-o-- ---------- ---0------ ------    0
      -----0-0-- ---------- ---------- 0-----    0

    6 -----i-i-- ---------- ---1------ ------    0
      -----o-o-- ---------- ---------- 0-----    0

    7 -----o-o-- ---------- ---0------ ------    0
      -----i-i-- ---------- ---------- 1-----    0

    8 -----i-i-- ---------- ---1------ ------    0
      -----1-1-- ---------- ---------- 1-----    0

    9 -----o-o-- ---------- ---0------ ------    0
      -----i-i-- ---------- ---------- 0-----    1
         31 TPO  

   10 -----i-i-- ---------- ---1------ ------    0
      -----o-o-- ---------- ---------- 1-----    1
         31 TPO  

   11 -----o-o-- ---------- ---0------ ------    0
      -----i-i-- ---------- ---------- 0-----    1
         31 TPO  

   12 -----i-i-- ---------- ---1------ ------    0
      -----o-o-- ---------- ---------- 1-----    1
         31 TPO  

Family 1444   phase likelihood = 0.038, 2d best = 0.035


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 --0---0-0o ---------- -----i---- -----o    2
         26 D2S46  36 ACP1  
      ------1--i -------i-- -----i---- ------    0

    4 --1---0-00 ---------- -----0---1 -----i    2
         3 CRYG1-5_3  
      ------0--0 -------o-- -----i---1 ------    1

    5 --0---0-0o ---------- -----i---- -----i    1
      ------1--i -------i-- -----i---- ------    0

    6 ------1-1i ---------- -----o---- -----o    1
      ------0--o -------o-- -----o---- ------    0

    7 --0---0-00 ---------- -----0---o -----i    1
         36 ACP1  
      ------0--0 -------o-- -----i---i ------    1

    8 --1---1-1i ---------- -----1---0 -----i    2
         30 D2S70  36 ACP1  
      ------0--o -------o-- -----o---0 ------    0

    9 --0---1-11 ---------- -----i---i -----i    1
         3 CRYG1-5_3  
      ------1--1 -------i-- -----i---o ------    1
         30 D2S70  

   10 --1---0-0o ---------- -----1---i -----i    2
         3 CRYG1-5_3  
      ------1--i -------o-- -----o---o ------    1

Family 1447   phase likelihood = 0.068, 2d best = 0.044


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ------1--- --i------- ---i-1---i --i---    0
      000---0--- 0------0-- ---o-i---- -----0    2
         26 D2S46  36 ACP1  

    4 ------1--- --i------- ---o-o---o --o---    1
      000---0--- 0------1-- ---i-i---- -----0    2
         36 ACP1  

    5 ------1--- --i------- -----o---o --o---    1
      000---0--- 0------1-- -----i---- -----1    1

    6 ------0--- --o------- ---o-o---o --o---    0
      000---0--- 0------0-- ---i-i---- -----1    1

    7 ------0--- --o------- ---o-o---o --o---    0
      111---0--- 0------0-- ---i-i---- -----1    2

    8 ------1--- --i------- ---i-1---o --i---    2
         30 D2S70  33 D2S47  
      111---1--- 1------1-- ---i-i---- -----0    1
         36 ACP1  

   13 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   14 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1451   phase likelihood = 0.123, 2d best = 0.123


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 iii---1--- ---------- ---------0 ------    1
         30 D2S70  
      1i1---1--- --1------- ---------- ------    0

    4 iii---0--- ---------- ---------0 ------    1
      1i1---0--- --1------- ---------- ------    2
         7 D2S44  13 D2S43  

    5 iii---1--- ---------- ---------0 ------    1
         30 D2S70  
      1i1---1--- --1------- ---------- ------    0

    6 iii---1--- ---------- ---------- ------    0
      ooo---0--- --0------- ---------- ------    0

    7 iii---1--- ---------- ---------0 ------    1
         30 D2S70  
      1i1---1--- --1------- ---------- ------    0

    8 iii---1--- ---------- ---------1 ------    0
      ooo---0--- --0------- ---------- ------    0

    9 ooo---1--- ---------- ---------0 ------    2
         7 D2S44  30 D2S70  
      iii---1--- --0------- ---------- ------    1
         13 D2S43  

   10 ooo---0--- ---------- ---------1 ------    1
         30 D2S70  
      iii---1--- --0------- ---------- ------    1
         13 D2S43  

Family 1454   phase likelihood = 0.302, 2d best = 0.112


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ooo---1--1 i--------- ---1-1---o --0---    2
      ------0--- o------1-- ---------1 -----0    2
         36 ACP1  

    4 ooo---1--0 0--------- ---0-0---i --1---    3
         7 D2S44  
      ------0--- 0--------- -------o-0 -----0    0

    5 iii---1--1 i--------- ---1-1---i --1---    0
      ------0--- o--------- -------o-0 -----0    0

    6 iii---1--1 i--------- ---1-1---i --0---    1
         33 D2S47  
      ------0--- o------1-- ---------i -----1    1

    7 ooo---0--0 o--------- ---0-0---i --1---    1
      ------0--- i--------- -------o-0 -----1    3
         7 D2S44  11 LCO  36 ACP1  

    8 iii---1--1 i--------- ---0-0---i --0---    3
         30 D2S70  33 D2S47  
      ------0--- o--------- -------o-0 -----0    0

    9 iii---1--1 i--------- ---0-1---i --0---    3
         24 D2S6  33 D2S47  
      ------0--- o--------- -------o-0 -----1    1
         36 ACP1  

   10 iii---1--1 1--------- ---0-1---i --0---    3
         24 D2S6  33 D2S47  
      ------1--- 1------1-- -------o-0 -----1    2
         36 ACP1  

   11 iii---0--0 o--------- ---0-0---o --0---    1
      ------1--- i------1-- -------o-o -----1    2
         36 ACP1  

   16 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1456   phase likelihood = 0.489, 2d best = 0.172


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 oo----0--- --0------- -----i---- --0---    2
         26 D2S46  33 D2S47  
      ------0--- 0------o-- ---i-i---- --0--0    2

    4 ii----1--- --0------- -----0---- --0---    1
      ------1--- 1------i-- ---i-1---- --0--0    1

    5 oo----0--- --0------- -----0---- --1---    1
         33 D2S47  
      ------0--- -------o-- ---i-1---- --1--1    1

    6 ii----1--- --1------- -----o---- --0---    1
      ------1--- -------i-- ---o-o---- --1--1    2

    7 oo----1--- --0------- -----1---- --1---    3
         7 D2S44  13 D2S43  
      ------1--- -------o-- ---o-0---- --0--0    1
         7 D2S44  

    8 oo----0--- --0------- -----1---- --0---    2
         26 D2S46  33 D2S47  
      ------1--- -------i-- ---o-0---- --1--1    2

    9 oo----0--- --0------- -----o---- --0---    0
      ------0--- -------o-- ---o-o---- --0--0    0

   10 -i----0--- --0------- -----0---- --0---    1
         2 CRYG1-5_2  
      ------1--- 1------i-- ---i-1---- --0--0    1

Family 1458   phase likelihood = 0.551, 2d best = 0.150


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 00o---1--- i--------- ---o-0---i ------    3
         30 D2S70  
      --o-----00 o--------- ---o------ ------    0

    4 00o---1--- i--------- ---------o ------    2
         30 D2S70  
      --o-----00 o--------- ---------- ------    0

    5 11i---1--- 1--------- ---------o ------    1
         30 D2S70  
      --i-----11 1--------- ---------- ------    0

    6 111---1--- o--------- ---0-----i ------    2         30 D2S70  
      --0-----11 i--------- ---1------ ------    1
         3 CRYG1-5_3  

    7 111---0--- 0--------- ---1-1---i ------    2
      --0-----00 0--------- ---0------ ------    0

    8 11i---0--- 1--------- ---1-1---i ------    2
         7 D2S44  
      --i-----11 1--------- ---0------ ------    1
         24 D2S6  

    9 00o---0--- 0--------- ---0-0---o ------    0
      --o-----00 0--------- ---1------ ------    1
         24 D2S6  

   14 ---------- i--------- ---------i ------    0
      ---------- o--------- ---------- ------    0

Family 1459   phase likelihood = 0.073, 2d best = 0.066


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 1i1------- ---------- -----i---- --1---    0
      -i--1----- 1--------- -----o---- --0--0    1

    4 111------- ---------- -----i---- --1---    0
      -0--0----- 0--------- -----o---- --1--1    1

    5 1i1------- ---------- -----i---- --1---    0
      -i--0----- 0--------- -----o---- --0--0    1
         2 CRYG1-5_2  

    6 0o0------- ---------- -----i---- --1---    1
      -o--1----- 1--------- -----o---- --0--0    2
         2 CRYG1-5_2  

    7 111------- ---------- -----1---- --1---    0
      -0--1----- 1--------- -----1---- --1--0    2
         2 CRYG1-5_2  36 ACP1  

    8 111------- ---------- -----o---- --0---    1
      -0--1----- ---------- -----i---- --0--0    2
         2 CRYG1-5_2  

   13 111------- ---------- -----1---- --1---    0
      -0--1----- 1--------- -----1---- --1---    1
         2 CRYG1-5_2  

Family 1463   phase likelihood = 0.027, 2d best = 0.027


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 11----1-11 --1----0-- -----o---- ------    1
      ------0--0 0-0----0-- -----o---0 --0---    0

    4 00----0-0o --0----o-- -----i---- ------    1
         26 D2S46  
      ------0--o --1----i-- -----i---1 --0---    2
         33 D2S47  

    5 11----0-00 --0----o-- -----o---- ------    1
      ------0--1 1-1----i-- -----i---1 --0---    2
         7 D2S44  33 D2S47  

    6 11----0-00 --0----o-- -----i---- ------    2
         26 D2S46  
      ------1--1 1-1----i-- -----i---1 --0---    1
         33 D2S47  

    7 11----0-00 --i----o-- -----o---- ------    3
         13 D2S43  
      ------1--1 1-i----i-- -----i---1 --0---    1
         33 D2S47  

    8 11----0-00 --0----o-- -----o---- ------    1
      ------1--1 1-1----i-- -----o---0 --1---    2
         33 D2S47  

    9 00----1-1i --i----1-- -----o---- ------    2
         26 D2S46  
      ------1--i 1-i----1-- -----i---1 --1---    0

   10 00----0-0o --o----0-- -----i---- ------    1
         26 D2S46  
      ------0--o 0-o----0-- -----i---1 --1---    1

   11 11----0-0o --o----o-- -----o---- ------    1
      ------0--o 0-o----i-- -----i---1 --1---    1

   12 11----0-00 --0----1-- -----o---- ------    3
         18 D2S45  26 D2S46  
      ------1--1 1-1----1-- -----i---1 --0---    1
         33 D2S47  

   17 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1400   phase likelihood = 1.000, 2d best = 0.000


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    6 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    7 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    8 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1427   phase likelihood = 1.000, 2d best = 0.000


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    6 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    7 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    8 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    9 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1477   phase likelihood = 1.000, 2d best = 0.000


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    6 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    7 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    8 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    9 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   10 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   11 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

Family 1582   phase likelihood = 1.000, 2d best = 0.000


    1 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    2 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    3 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    4 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    5 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    6 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    7 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    8 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

    9 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0

   10 ---------- ---------- ---------- ------    0
      ---------- ---------- ---------- ------    0




CROSSOVER CHROMOSOMES FOR EACH INFORMATIVE INTERVAL

1  6
13291-4-P  

1  7
1354-11-P  1354-8-P  1354-5-P  1328-11-M  1328-8-M  1328-3-M  

2  4
1332-8-M  1332-6-M  1332-3-M  

2  5
1459-13-P  1459-8-P  1459-7-P  1459-6-P  1459-5-P  1418-10-P  1418-4-P  1375-6-P  1332-7-M  1332-4-M  

2  6
45-4-P  28-8-P  28-6-P  2-9-P  

2  7
1463-12-M  1463-11-M  1463-9-M  1463-8-M  1463-7-M  1463-6-M  1463-5-M  1456-10-M  1456-7-M  28-3-P  
23-4-P  12-7-M  12-3-M  1424-10-M  1424-8-M  1375-7-M  1353-15-M  1353-10-M  1353-9-M  1353-6-M  
1353-4-M  1353-3-M  1350-7-M  1349-9-P  1330-5-M  1330-3-M  

2  8
1349-5-M  1349-4-M  

2  9
1341-10-M  1341-3-M  

2  11
1357-10-P  1341-7-M  1341-6-M  

2  13
1357-13-P  

3  4
1421-6-P  1421-5-M  1421-3-M  1362-12-P  1341-6-P  1341-5-P  1341-4-P  1341-3-P  1334-5-M  

3  5
45-5-M  45-4-M  28-9-M  28-3-M  1418-9-M  1418-6-M  1418-5-M  1418-3-M  1359-18-M  1359-15-M  
1334-8-M  

3  6
66-9-M  1424-8-P  1424-7-P  1424-5-P  1424-3-P  1350-7-P  

3  7
1458-8-M  1458-7-M  1458-4-M  1458-3-M  1454-11-M  1454-4-M  1454-3-M  1451-9-M  1451-4-P  1451-4-M  
1447-7-P  1444-10-M  1444-9-M  1444-4-M  12-7-P  1416-15-M  1416-10-M  1416-8-M  1416-7-M  1416-4-M  
1416-3-M  1408-6-P  1408-3-P  1377-14-P  1377-9-P  1377-3-P  1359-12-P  1359-9-P  1359-7-P  1359-4-P  
1344-11-P  1344-9-P  1344-8-P  1344-6-P  

3  8
1362-11-M  1362-10-M  1362-7-M  1362-5-M  1362-4-M  

3  9
1458-6-P  

3  15
66-9-P  66-7-P  66-5-P  66-4-P  66-3-P  

3  26
1459-8-M  1459-6-M  

4  5
1334-6-M  1333-10-M  1333-9-M  1333-8-M  1333-7-M  1333-3-M  1332-10-M  1332-8-M  

4  6
13294-6-M  13294-4-M  

4  7
1421-12-M  1421-6-P  1421-5-P  1421-4-M  1421-3-P  1416-10-P  1416-9-P  1413-17-P  1413-17-M  1413-15-P  
1345-8-M  1345-7-M  1345-6-M  1345-3-M  1341-8-P  

4  8
1362-7-P  1346-7-M  1346-5-M  1345-9-M  

4  9
1346-9-P  1346-8-P  

4  12
1345-9-P  

5  6
1418-10-P  1334-8-M  13291-6-M  

5  7
1359-13-M  1359-12-M  1359-11-M  1359-10-M  1359-9-M  1359-5-M  1344-9-M  1344-6-M  1333-9-M  1333-8-M  
1332-8-M  1332-4-M  

5  8
1418-8-M  1331-11-M  1331-9-M  1331-6-M  1331-4-M  

6  7
2-5-P  1420-8-P  1350-9-P  1350-5-P  13292-4-P  

6  8
104-3-M  45-9-P  35-6-P  35-4-M  17-10-M  

6  9
17-6-P  

6  11
1350-6-P  

6  12
884-10-M  884-6-M  

6  13
1418-10-P  

7  8
28-9-P  28-5-P  37-5-M  1421-7-P  1416-7-P  1350-4-M  1333-10-P  1332-8-M  13291-8-P  

7  9
1416-10-M  1416-5-M  1359-5-M  1356-11-M  1356-9-M  1345-5-P  

7  10
1463-5-P  1454-4-M  23-5-P  23-3-P  1354-6-P  

7  11
1458-8-M  1458-6-M  1454-7-P  1359-15-P  1359-10-P  1359-6-P  1359-5-P  1359-3-P  1349-7-P  13292-3-M  

7  12
1334-9-M  1334-8-M  13293-9-M  13293-7-M  13293-4-M  13291-6-M  

7  13
1456-7-M  1456-4-M  1451-10-P  1451-9-P  1451-4-P  1341-7-P  

7  14
13291-7-M  

7  18
1456-7-P  

7  24
1408-14-P  1408-8-P  1408-6-P  1408-5-P  1408-3-P  1328-11-M  1328-10-P  1328-6-M  1328-3-P  

7  26
13281-5-M  

7  27
1329-5-P  1328-9-M  1328-8-P  

7  28
13281-3-M  

7  29
13281-5-P  13281-3-P  

7  30
1451-10-M  1451-9-M  1451-7-M  1451-5-M  1451-3-M  

7  33
1356-17-P  1356-16-P  1356-9-P  1356-7-P  1356-5-P  

8  9
1350-4-M  

8  10
102-12-M  102-11-M  102-10-M  102-3-M  

8  11
1375-13-P  1375-6-P  1375-5-P  1375-4-P  1362-7-M  1340-8-M  1331-6-M  13292-3-P  

8  12
1421-11-M  1413-14-M  1362-3-P  1344-5-M  

8  13
28-8-P  37-6-M  17-5-M  12-7-P  1418-8-M  1349-7-M  1349-5-M  1346-8-M  1346-4-M  

8  14
1333-10-P  1333-5-P  

8  15
1423-9-M  1423-8-M  1423-7-M  1423-6-M  1423-4-M  

8  16
1350-6-M  

8  17
1413-9-M  

8  18
45-7-M  45-4-M  

8  24
21-7-M  1344-6-M  

8  26
21-8-M  

8  27
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26  32
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26  33
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45-4-P  1418-10-M  1418-8-M  1418-6-M  1418-5-M  1418-3-M  

26  35
1424-8-P  1424-6-P  1424-5-P  1424-4-P  

26  36
1447-8-P  1447-4-P  1447-3-P  1444-3-M  1357-17-M  1357-7-M  1357-6-M  1357-4-M  

27  28
1416-8-M  1358-6-P  13291-9-M  1328-9-M  1328-8-M  1328-6-M  

27  29
1347-4-P  1345-5-P  1340-8-M  1330-3-M  13292-5-M  1328-7-P  1328-6-P  1328-4-M  

27  30
2-7-P  2-3-P  1413-14-M  1345-6-M  1345-3-M  1340-5-M  1333-7-P  

27  31
102-16-P  102-13-M  102-12-M  102-10-P  102-8-P  102-7-P  102-3-M  21-5-M  1377-7-P  1362-7-P  
1331-9-M  1331-8-M  1331-6-M  

27  32
35-8-M  35-3-M  1413-13-P  1413-12-P  1413-9-P  1413-8-P  1413-7-P  1413-5-P  1408-14-M  1408-9-M  
1408-8-M  1408-6-M  1408-5-M  1408-3-M  

27  33
23-7-M  23-6-M  1418-9-P  1418-6-P  1418-3-P  1350-8-P  1344-5-P  

27  35
1333-5-P  1333-3-P  

27  36
1329-6-M  1329-3-M  

28  30
2-3-M  1354-13-P  1354-12-P  

28  31
37-9-M  37-8-M  1375-7-M  1375-6-M  1362-17-P  1362-8-P  1362-6-P  1362-5-P  1362-3-P  1349-9-M  

28  32
1416-15-M  1416-8-M  1416-6-M  1416-5-M  1362-3-M  

28  33
1416-10-M  1357-17-P  1357-4-P  1357-3-P  1350-5-M  1350-3-P  

28  34
1350-4-M  1349-8-M  

28  35
1349-5-M  

28  36
1358-9-M  1358-7-M  1358-6-M  1358-5-M  1358-4-M  

29  30
13294-3-P  

29  31
1347-11-M  1347-10-P  1347-9-P  1347-8-M  1347-7-M  1347-3-P  1345-3-P  1331-9-P  1331-3-P  

29  32
1341-10-P  1341-9-P  1341-8-P  1341-5-P  1340-8-M  13294-8-M  13294-5-M  13294-4-M  13292-5-P  

29  33
1346-10-M  1346-8-P  1346-4-M  1344-5-M  1333-9-M  1333-4-M  1333-3-M  1331-5-P  1328-10-P  1328-9-P  
1328-5-P  

29  34
1345-6-P  

30  31
37-5-P  12-7-P  12-5-P  1377-8-M  1377-6-M  1334-7-P  1334-6-P  1334-4-P  13293-9-P  13293-9-M  
13293-7-P  13293-6-P  13293-5-P  13293-3-M  

30  32
1413-15-M  1413-12-M  1413-11-M  1413-7-M  1413-5-M  1362-17-M  1362-11-M  1362-9-M  1341-8-M  1341-6-M  
1341-4-M  1341-3-M  1340-7-M  

30  33
1463-12-P  1463-8-P  1463-7-P  1463-6-P  1463-5-P  1463-4-P  1454-10-M  1454-9-M  1454-8-M  1454-6-M  
1447-8-M  2-9-P  2-5-P  1362-7-M  1354-6-P  1354-5-P  1354-3-P  1345-6-M  1344-11-M  1344-10-M  
1344-6-M  1344-4-P  1330-7-P  1330-3-P  13292-7-M  13292-6-M  13292-3-M  

30  34
13291-5-M  13291-4-M  13291-3-M  

30  35
1333-6-P  

30  36
1454-11-P  1454-10-P  1454-9-P  1454-7-P  1454-3-P  1444-8-M  1444-7-M  

31  33
1377-9-M  1377-8-M  1347-10-P  1347-10-M  1331-11-P  

32  34
1340-8-M  1340-6-P  1340-3-M  

32  35
1341-9-M  

32  36
13292-7-P  

33  34
1331-10-P  

33  35
1346-10-M  

33  36
1459-7-P  1359-6-P  

34  36
1340-3-P  

35  36
1345-7-M  1345-6-M  1333-10-M  13292-3-M  




CONSECUTIVE LOCI UNSEPARATED BY CROSSOVERS: 

1 2 3 
2 3 
9 10 
16 17 
21 22 
28 29 
31 32 
32 33 
34 35 


Sex_averaged map (recomb. frac., Kosambi cM):

  1   CRYG1-5                     0.0                    
                    0.00*   0.0
  2   CRYG1-5_2                   0.0                    
                    0.00*   0.0
  3   CRYG1-5_3                   0.0                    
                    0.26   28.3
  4   D2S40                      28.3                    
                    0.20   21.7
  5   D2S51                      50.0                    
                    0.10    9.6
  6   LCT                        59.6                    
                    0.06    6.2
  7   D2S44                      65.8                    
                    0.04    3.8
  8   Prot_C/pcr                 69.6                    
                    0.04    3.7
  9   D2S54                      73.3                    
                    0.00*   0.0
 10   D2S54_2                    73.3                    
                    0.06    5.8
 11   LCO                        79.1                    
                    0.04    4.4
 12   D2S41                      83.4                    
                    0.04    3.8
 13   D2S43                      87.2                    
                    0.12   12.0
 14   D2S25                      99.2                    
                    0.03    2.9
 15   D2S62                     102.1                    
                    0.02    1.9
 16   D2S38_2                   104.0                    
                    0.00*   0.0
 17   D2S38                     104.0                    
                    0.12   12.4
 18   D2S45                     116.4                    
                    0.10    9.8
 19   D2S30                     126.2                    
                    0.08    7.9
 20   D2S31                     134.1                    
                    0.03    3.1
 21   D2S5_2                    137.2                    
                    0.00*   0.0
 22   D2S5                      137.2                    
                    0.06    5.7
 23   D2S28                     142.9                    
                    0.17   17.5
 24   D2S6                      160.4                    
                    0.03    3.0
 25   D2S19                     163.4                    
                    0.10   10.3
 26   D2S46                     173.7                    
                    0.09    9.5
 27   D2S48                     183.2                    
                    0.12   12.2
 28   APOB_2                    195.3                    
                    0.00*   0.0
 29   APOB                      195.3                    
                    0.06    6.2
 30   D2S70                     201.6                    
                    0.35   44.1
 31   TPO                       245.7                    
                    0.00*   0.0
 32   TPO_2                     245.7                    
                    0.03    3.2
 33   D2S47                     248.9                    
                    0.01    1.4
 34   D2S1_2                    250.3                    
                    0.00*   0.0
 35   D2S1                      250.3                    
                    0.04    3.7
 36   ACP1                      254.0                    

* denotes recomb. frac. held fixed in this analysis


log10_like = -1141.012