Authors:
Hawken R J, Zhang Y D, Fortes M R S, Collis E, Barris W C, Corbet N J, Williams P J, Fordyce G, Holroyd R G, Walkley J R W, Barendse W, Johnston D J, Prayaga K C, Tier B, Reverter A, Lehnert S A
(Contact: Sigrid.lehnert@csiro.au )
Affiliation:
Cooperative Research Centre for Beef Genetic Technologies, University of New England, Armidale, New South Wales 2351, Australia
Title:
Genome-wide association studies of female reproduction in tropically adapted beef cattle
Journal:
Journal Of Animal Science, 90(5): 1398-410 (2012)
DOI :
10.2527/jas.2011-4410
Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Age at puberty reported for chromosome(s):
Chr.1 : Asso:29789 , Asso:29809 , Asso:29820 , Asso:29826 , Asso:29831 , Asso:29833 , Asso:29861 , Asso:29868 , Asso:29874 , Asso:29878 , Asso:29904 , Asso:29924 , Asso:29928 , Asso:29929 , Asso:29977 . Chr.2 : Asso:29775 , Asso:29776 , Asso:29804 , Asso:29812 , Asso:29863 , Asso:29881 , Asso:29883 , Asso:29899 , Asso:29915 . Chr.3 : Asso:29818 , Asso:29850 , Asso:29869 , Asso:29889 , Asso:29894 , Asso:29900 . Chr.4 : Asso:29816 , Asso:29837 , Asso:29879 , Asso:29880 , Asso:29952 . Chr.5 : Asso:29800 , Asso:29811 , Asso:29855 , Asso:29902 , Asso:29903 , Asso:29906 , Asso:29907 , Asso:29909 , Asso:29912 , Asso:29913 , Asso:29916 , Asso:29921 , Asso:29930 , Asso:29932 , Asso:29934 , Asso:29947 , Asso:29951 , Asso:29968 , Asso:29988 , Asso:29989 . Chr.6 : Asso:29841 , Asso:29893 , Asso:29901 , Asso:29914 , Asso:29975 , Asso:29987 . Chr.7 : Asso:29807 , Asso:29817 , Asso:29864 , Asso:29905 , Asso:29910 , Asso:29931 , Asso:29937 , Asso:29959 , Asso:29961 , Asso:29962 , Asso:29963 , Asso:29980 . Chr.8 : Asso:29805 , Asso:29845 , Asso:29853 , Asso:29871 , Asso:29872 , Asso:29877 , Asso:29886 , Asso:29943 , Asso:29944 , Asso:29967 . Chr.9 : Asso:29815 , Asso:29857 , Asso:29897 , Asso:29923 . Chr.10 : Asso:29777 , Asso:29790 , Asso:29821 , Asso:29849 , Asso:29858 , Asso:29867 , Asso:29875 , Asso:29876 , Asso:29890 , Asso:29927 , Asso:29935 , Asso:29948 , Asso:29970 , Asso:29972 , Asso:29981 . Chr.12 : Asso:29908 . Chr.13 : Asso:29764 , Asso:29795 , Asso:29854 , Asso:29896 , Asso:29958 . Chr.14 : Asso:29735 , Asso:29736 , Asso:29737 , Asso:29738 , Asso:29739 , Asso:29740 , Asso:29741 , Asso:29742 , Asso:29743 , Asso:29744 , Asso:29745 , Asso:29746 , Asso:29747 , Asso:29748 , Asso:29749 , Asso:29750 , Asso:29751 , Asso:29752 , Asso:29753 , Asso:29754 , Asso:29755 , Asso:29756 , Asso:29757 , Asso:29758 , Asso:29759 , Asso:29760 , Asso:29761 , Asso:29762 , Asso:29763 , Asso:29765 , Asso:29766 , Asso:29767 , Asso:29768 , Asso:29769 , Asso:29770 , Asso:29771 , Asso:29772 , Asso:29773 , Asso:29778 , Asso:29780 , Asso:29781 , Asso:29782 , Asso:29783 , Asso:29784 , Asso:29785 , Asso:29786 , Asso:29788 , Asso:29791 , Asso:29792 , Asso:29793 , Asso:29796 , Asso:29802 , Asso:29803 , Asso:29808 , Asso:29810 , Asso:29813 , Asso:29819 , Asso:29822 , Asso:29823 , Asso:29828 , Asso:29834 , Asso:29835 , Asso:29836 , Asso:29839 , Asso:29843 , Asso:29844 , Asso:29846 , Asso:29885 , Asso:29887 , Asso:29891 , Asso:29926 , Asso:29965 , Asso:29979 . Chr.15 : Asso:29774 , Asso:29779 , Asso:29787 , Asso:29798 , Asso:29801 , Asso:29824 , Asso:29825 , Asso:29829 , Asso:29830 , Asso:29832 , Asso:29870 , Asso:29873 , Asso:29882 , Asso:29888 , Asso:29898 , Asso:29974 , Asso:29984 . Chr.16 : Asso:29892 , Asso:29936 , Asso:29983 . Chr.17 : Asso:29851 , Asso:29852 , Asso:29866 , Asso:29895 , Asso:29917 , Asso:29918 , Asso:29925 , Asso:29938 , Asso:29969 . Chr.18 : Asso:29814 , Asso:29856 , Asso:29865 , Asso:29922 , Asso:29953 , Asso:29966 . Chr.19 : Asso:29884 , Asso:29973 , Asso:29978 , Asso:29982 , Asso:29985 , Asso:29986 . Chr.20 : Asso:29945 , Asso:29956 . Chr.21 : Asso:29794 , Asso:29797 , Asso:29806 , Asso:29840 , Asso:29842 , Asso:29847 , Asso:29859 , Asso:29949 , Asso:29960 , Asso:29964 . Chr.22 : Asso:29848 . Chr.23 : Asso:29827 , Asso:29862 . Chr.24 : Asso:29920 , Asso:29942 . Chr.25 : Asso:29911 , Asso:29955 . Chr.26 : Asso:29933 , Asso:29939 , Asso:29940 , Asso:29941 , Asso:29946 , Asso:29950 , Asso:29957 , Asso:29971 , Asso:29976 . Chr.27 : Asso:29799 , Asso:29860 , Asso:29919 . Chr.28 : Asso:29838 . Chr.29 : Asso:29954 .
QTL for Interval to first estrus after calving reported for chromosome(s):
Chr.X : Asso:30105 , Asso:30110 , Asso:30331 , Asso:30386 . Chr.1 : Asso:30038 , Asso:30108 , Asso:30164 , Asso:30230 , Asso:30240 , Asso:30365 , Asso:30367 , Asso:30421 , Asso:30435 , Asso:30442 . Chr.2 : Asso:30003 , Asso:30049 , Asso:30088 , Asso:30109 , Asso:30181 , Asso:30202 , Asso:30243 , Asso:30252 , Asso:30300 , Asso:30346 , Asso:30368 , Asso:30451 , Asso:30467 , Asso:30477 . Chr.3 : Asso:29999 , Asso:30008 , Asso:30012 , Asso:30018 , Asso:30036 , Asso:30046 , Asso:30048 , Asso:30052 , Asso:30059 , Asso:30070 , Asso:30072 , Asso:30080 , Asso:30086 , Asso:30121 , Asso:30214 , Asso:30244 , Asso:30258 , Asso:30261 , Asso:30263 , Asso:30280 , Asso:30283 , Asso:30284 , Asso:30286 , Asso:30290 , Asso:30307 , Asso:30311 , Asso:30312 , Asso:30316 , Asso:30353 , Asso:30380 , Asso:30426 . Chr.4 : Asso:30010 , Asso:30023 , Asso:30107 , Asso:30172 , Asso:30273 , Asso:30313 , Asso:30342 , Asso:30471 . Chr.5 : Asso:30041 , Asso:30058 , Asso:30097 , Asso:30099 , Asso:30101 , Asso:30102 , Asso:30116 , Asso:30124 , Asso:30127 , Asso:30129 , Asso:30138 , Asso:30142 , Asso:30143 , Asso:30145 , Asso:30147 , Asso:30150 , Asso:30153 , Asso:30154 , Asso:30162 , Asso:30165 , Asso:30171 , Asso:30175 , Asso:30179 , Asso:30199 , Asso:30211 , Asso:30221 , Asso:30224 , Asso:30228 , Asso:30229 , Asso:30238 , Asso:30239 , Asso:30241 , Asso:30242 , Asso:30327 , Asso:30329 , Asso:30330 , Asso:30334 , Asso:30337 , Asso:30344 , Asso:30348 , Asso:30352 , Asso:30356 , Asso:30360 , Asso:30361 , Asso:30374 , Asso:30378 , Asso:30382 , Asso:30384 , Asso:30385 , Asso:30396 , Asso:30404 , Asso:30405 , Asso:30407 , Asso:30409 , Asso:30414 , Asso:30415 , Asso:30416 , Asso:30430 , Asso:30431 , Asso:30436 , Asso:30437 , Asso:30446 , Asso:30453 , Asso:30469 , Asso:30475 . Chr.6 : Asso:29990 , Asso:30004 , Asso:30054 , Asso:30078 , Asso:30112 , Asso:30119 , Asso:30130 , Asso:30152 , Asso:30160 , Asso:30176 , Asso:30182 , Asso:30206 , Asso:30208 , Asso:30210 , Asso:30216 , Asso:30218 , Asso:30223 , Asso:30231 , Asso:30250 , Asso:30255 , Asso:30293 , Asso:30296 , Asso:30299 , Asso:30339 , Asso:30366 , Asso:30372 , Asso:30379 , Asso:30381 , Asso:30389 , Asso:30393 , Asso:30418 , Asso:30424 , Asso:30449 , Asso:30450 , Asso:30461 , Asso:30466 . Chr.7 : Asso:30040 , Asso:30146 , Asso:30158 , Asso:30197 , Asso:30233 , Asso:30324 , Asso:30441 , Asso:30444 , Asso:30454 , Asso:30460 , Asso:30476 . Chr.8 : Asso:29993 , Asso:30029 , Asso:30032 , Asso:30051 , Asso:30077 , Asso:30209 , Asso:30247 , Asso:30291 , Asso:30298 , Asso:30322 , Asso:30325 . Chr.9 : Asso:30087 , Asso:30125 , Asso:30184 , Asso:30191 , Asso:30192 , Asso:30205 , Asso:30267 , Asso:30279 , Asso:30309 , Asso:30364 , Asso:30388 , Asso:30458 , Asso:30479 . Chr.10 : Asso:30020 , Asso:30022 , Asso:30028 , Asso:30039 , Asso:30136 , Asso:30159 , Asso:30166 , Asso:30186 , Asso:30196 , Asso:30200 , Asso:30433 , Asso:30448 , Asso:30452 , Asso:30465 . Chr.11 : Asso:29998 , Asso:30027 , Asso:30063 , Asso:30115 , Asso:30120 , Asso:30126 , Asso:30137 , Asso:30156 , Asso:30169 , Asso:30245 , Asso:30248 , Asso:30323 , Asso:30340 , Asso:30341 , Asso:30408 , Asso:30420 , Asso:30425 , Asso:30432 , Asso:30474 , Asso:30478 . Chr.12 : Asso:30015 , Asso:30045 , Asso:30069 , Asso:30096 , Asso:30134 , Asso:30188 , Asso:30203 , Asso:30257 , Asso:30303 , Asso:30321 , Asso:30333 , Asso:30335 , Asso:30473 . Chr.13 : Asso:30014 , Asso:30064 , Asso:30085 , Asso:30149 , Asso:30222 , Asso:30226 , Asso:30234 , Asso:30254 , Asso:30272 , Asso:30294 , Asso:30394 , Asso:30398 , Asso:30410 , Asso:30438 . Chr.14 : Asso:29995 , Asso:30000 , Asso:30001 , Asso:30002 , Asso:30005 , Asso:30009 , Asso:30011 , Asso:30013 , Asso:30019 , Asso:30037 , Asso:30044 , Asso:30060 , Asso:30062 , Asso:30065 , Asso:30066 , Asso:30067 , Asso:30068 , Asso:30073 , Asso:30075 , Asso:30079 , Asso:30081 , Asso:30083 , Asso:30089 , Asso:30090 , Asso:30091 , Asso:30092 , Asso:30093 , Asso:30094 , Asso:30095 , Asso:30219 , Asso:30270 , Asso:30278 , Asso:30297 , Asso:30302 , Asso:30306 , Asso:30319 , Asso:30440 . Chr.15 : Asso:30056 , Asso:30061 , Asso:30177 , Asso:30246 , Asso:30428 . Chr.16 : Asso:29997 , Asso:30055 , Asso:30100 , Asso:30104 , Asso:30114 , Asso:30118 , Asso:30123 , Asso:30128 , Asso:30133 , Asso:30141 , Asso:30144 , Asso:30148 , Asso:30151 , Asso:30155 , Asso:30161 , Asso:30163 , Asso:30168 , Asso:30173 , Asso:30180 , Asso:30194 , Asso:30198 , Asso:30207 , Asso:30213 , Asso:30215 , Asso:30225 , Asso:30232 , Asso:30237 , Asso:30281 , Asso:30338 , Asso:30343 , Asso:30345 , Asso:30349 , Asso:30354 , Asso:30355 , Asso:30362 , Asso:30363 , Asso:30369 , Asso:30375 , Asso:30376 , Asso:30383 , Asso:30387 , Asso:30391 , Asso:30395 , Asso:30399 , Asso:30402 , Asso:30411 , Asso:30412 , Asso:30417 , Asso:30443 , Asso:30445 , Asso:30447 , Asso:30462 , Asso:30468 . Chr.17 : Asso:29992 , Asso:29994 , Asso:29996 , Asso:30031 , Asso:30057 , Asso:30071 , Asso:30131 , Asso:30132 , Asso:30195 , Asso:30275 , Asso:30276 , Asso:30277 , Asso:30292 , Asso:30305 , Asso:30315 , Asso:30328 , Asso:30347 , Asso:30400 , Asso:30413 , Asso:30429 . Chr.18 : Asso:30103 , Asso:30350 , Asso:30357 , Asso:30373 , Asso:30377 , Asso:30392 , Asso:30401 . Chr.19 : Asso:29991 , Asso:30043 , Asso:30047 , Asso:30050 , Asso:30189 , Asso:30190 , Asso:30193 , Asso:30204 , Asso:30251 , Asso:30256 , Asso:30317 . Chr.21 : Asso:30007 , Asso:30021 , Asso:30026 , Asso:30033 , Asso:30034 , Asso:30053 , Asso:30076 , Asso:30084 , Asso:30098 , Asso:30140 , Asso:30174 , Asso:30187 , Asso:30227 , Asso:30236 , Asso:30249 , Asso:30253 , Asso:30259 , Asso:30264 , Asso:30266 , Asso:30268 , Asso:30285 , Asso:30289 , Asso:30308 , Asso:30314 , Asso:30320 , Asso:30336 , Asso:30403 , Asso:30406 , Asso:30419 , Asso:30427 , Asso:30459 , Asso:30463 , Asso:30464 . Chr.22 : Asso:30139 , Asso:30217 , Asso:30274 , Asso:30390 , Asso:30422 , Asso:30470 . Chr.23 : Asso:30006 , Asso:30074 , Asso:30135 , Asso:30157 , Asso:30185 , Asso:30265 , Asso:30371 , Asso:30439 , Asso:30472 . Chr.24 : Asso:30082 , Asso:30106 , Asso:30117 , Asso:30122 , Asso:30178 , Asso:30269 , Asso:30304 , Asso:30351 , Asso:30358 , Asso:30359 . Chr.25 : Asso:30024 , Asso:30212 , Asso:30318 , Asso:30397 . Chr.26 : Asso:30295 . Chr.27 : Asso:30030 , Asso:30042 , Asso:30167 , Asso:30170 , Asso:30201 , Asso:30271 , Asso:30288 , Asso:30326 , Asso:30423 , Asso:30455 , Asso:30456 . Chr.28 : Asso:30025 , Asso:30287 . Chr.29 : Asso:30016 , Asso:30017 , Asso:30035 , Asso:30111 , Asso:30113 , Asso:30183 , Asso:30220 , Asso:30235 , Asso:30260 , Asso:30262 , Asso:30282 , Asso:30301 , Asso:30310 , Asso:30332 , Asso:30370 , Asso:30434 , Asso:30457 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.X (4) ,
Chr.1 (25) ,
Chr.2 (23) ,
Chr.3 (37) ,
Chr.4 (13) ,
Chr.5 (85) ,
Chr.6 (42) ,
Chr.7 (23) ,
Chr.8 (21) ,
Chr.9 (17) ,
Chr.10 (29) ,
Chr.11 (20) ,
Chr.12 (14) ,
Chr.13 (19) ,
Chr.14 (110) ,
Chr.15 (22) ,
Chr.16 (56) ,
Chr.17 (29) ,
Chr.18 (13) ,
Chr.19 (17) ,
Chr.20 (2) ,
Chr.21 (43) ,
Chr.22 (7) ,
Chr.23 (11) ,
Chr.24 (12) ,
Chr.25 (6) ,
Chr.26 (10) ,
Chr.27 (14) ,
Chr.28 (3) ,
Chr.29 (18) .
Number of gene-based eQTL/associations: