Authors: Zhang R, Zhang Y, Liu T, Jiang B, Li Z, Qu Y, Chen Y, Li Z
(Contact: lizhc7@mail.sysu.edu.cn ) Affiliation: State Key Laboratory of Biocontrol, School of Life Sciences, Sun Yat-Sen University, Guangzhou 510006, China Title: Utilizing Variants Identified with Multiple Genome-Wide Association Study Methods Optimizes Genomic Selection for Growth Traits in Pigs Journal: Animals : An Open Access Journal From MDPI, 13(4):722 (2023)
DOI :
10.3390/ani13040722 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Subcutaneous fat thickness
Chr.2 : Asso:263662 , Asso:263663 , Asso:263664 , Asso:263665 , Asso:263672 , Asso:263687 , Asso:263688 , Asso:263700 , Asso:263701 , Asso:263710 , Asso:263751 , Asso:263758 , Asso:263759 , Asso:263801 , Asso:263802 , Asso:263891 . Chr.4 : Asso:263760 , Asso:263803 , Asso:263804 . Chr.7 : Asso:263805 . Chr.8 : Asso:263779 , Asso:263806 , Asso:263807 , Asso:263808 , Asso:263809 , Asso:263832 . Chr.9 : Asso:263739 , Asso:263761 , Asso:263780 , Asso:263810 , Asso:263811 , Asso:263812 , Asso:263813 , Asso:263892 . Chr.10 : Asso:263814 . Chr.11 : Asso:263740 , Asso:263741 , Asso:263762 , Asso:263763 , Asso:263764 , Asso:263765 , Asso:263766 , Asso:263767 , Asso:263768 , Asso:263769 , Asso:263781 , Asso:263782 , Asso:263783 , Asso:263784 , Asso:263815 . Chr.12 : Asso:263752 , Asso:263893 . Chr.14 : Asso:263816 . Chr.15 : Asso:263742 , Asso:263743 , Asso:263744 , Asso:263817 , Asso:263873 , Asso:263894 , Asso:263895 . Chr.16 : Asso:263659 , Asso:263660 , Asso:263661 , Asso:263673 , Asso:263709 , Asso:263711 , Asso:263745 , Asso:263746 , Asso:263747 , Asso:263748 , Asso:263749 , Asso:263750 , Asso:263770 , Asso:263771 , Asso:263772 , Asso:263773 , Asso:263774 , Asso:263775 , Asso:263776 , Asso:263777 , Asso:263778 , Asso:263785 , Asso:263786 , Asso:263818 , Asso:263819 , Asso:263820 , Asso:263821 , Asso:263822 , Asso:263823 , Asso:263824 , Asso:263825 , Asso:263826 , Asso:263827 , Asso:263828 , Asso:263829 , Asso:263830 , Asso:263831 , Asso:263833 , Asso:263834 , Asso:263835 , Asso:263836 , Asso:263837 , Asso:263838 , Asso:263839 , Asso:263874 , Asso:263875 , Asso:263876 , Asso:263896 .
QTL for Body weight
Chr.1 : Asso:263730 , Asso:263842 . Chr.2 : Asso:263681 , Asso:263682 , Asso:263683 , Asso:263685 , Asso:263699 , Asso:263704 , Asso:263705 , Asso:263706 , Asso:263714 , Asso:263787 , Asso:263844 , Asso:263845 , Asso:263846 , Asso:263847 , Asso:263848 , Asso:263856 . Chr.3 : Asso:263680 , Asso:263757 , Asso:263788 . Chr.4 : Asso:263789 . Chr.5 : Asso:263790 , Asso:263857 . Chr.6 : Asso:263725 , Asso:263726 , Asso:263727 , Asso:263728 , Asso:263729 , Asso:263869 , Asso:263870 , Asso:263871 , Asso:263872 . Chr.7 : Asso:263753 , Asso:263791 , Asso:263849 . Chr.8 : Asso:263890 . Chr.9 : Asso:263678 , Asso:263679 , Asso:263686 , Asso:263702 , Asso:263703 , Asso:263707 , Asso:263708 , Asso:263712 , Asso:263713 , Asso:263715 . Chr.10 : Asso:263670 , Asso:263674 , Asso:263675 , Asso:263676 , Asso:263677 , Asso:263684 . Chr.11 : Asso:263689 , Asso:263690 , Asso:263691 , Asso:263692 , Asso:263694 , Asso:263695 , Asso:263696 , Asso:263697 , Asso:263698 , Asso:263716 , Asso:263840 , Asso:263841 , Asso:263850 , Asso:263851 , Asso:263860 , Asso:263861 , Asso:263862 , Asso:263863 , Asso:263864 , Asso:263865 . Chr.12 : Asso:263792 . Chr.14 : Asso:263666 , Asso:263667 , Asso:263668 , Asso:263754 , Asso:263755 , Asso:263756 , Asso:263877 , Asso:263878 , Asso:263879 . Chr.15 : Asso:263793 , Asso:263794 , Asso:263795 , Asso:263796 , Asso:263797 , Asso:263798 , Asso:263799 . Chr.16 : Asso:263800 , Asso:263858 .
QTL for Average daily gain
Chr.1 : Asso:263724 , Asso:263737 , Asso:263738 , Asso:263843 . Chr.2 : Asso:263880 . Chr.13 : Asso:263731 . Chr.15 : Asso:263866 . Chr.18 : Asso:263669 , Asso:263671 , Asso:263693 , Asso:263717 , Asso:263718 , Asso:263719 , Asso:263720 , Asso:263721 , Asso:263722 , Asso:263723 , Asso:263732 , Asso:263733 , Asso:263734 , Asso:263735 , Asso:263736 , Asso:263852 , Asso:263853 , Asso:263854 , Asso:263855 , Asso:263859 , Asso:263867 , Asso:263868 , Asso:263881 , Asso:263882 , Asso:263883 , Asso:263884 , Asso:263885 , Asso:263886 , Asso:263887 , Asso:263888 , Asso:263889 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (6) ,
Chr.2 (33) ,
Chr.3 (3) ,
Chr.4 (4) ,
Chr.5 (2) ,
Chr.6 (9) ,
Chr.7 (4) ,
Chr.8 (7) ,
Chr.9 (18) ,
Chr.10 (7) ,
Chr.11 (35) ,
Chr.12 (3) ,
Chr.13 (1) ,
Chr.14 (10) ,
Chr.15 (15) ,
Chr.16 (50) ,
Chr.18 (31) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Zhang R, Zhang Y, Liu T, Jiang B, Li Z, Qu Y, Chen Y, Li Z (2023). Utilizing Variants Identified with Multiple Genome-Wide Association Study Methods Optimizes Genomic Selection for Growth Traits in Pigs. Animals : an open access journal from MDPI, 13(4):722;
Curated into QTLdb on 2023-03-07. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=IuEo2U7FiY
OR
Zhang R, Zhang Y, Liu T, Jiang B, Li Z, Qu Y, Chen Y, Li Z (2023). Utilizing Variants Identified with Multiple Genome-Wide Association Study Methods Optimizes Genomic Selection for Growth Traits in Pigs. Animals : an open access journal from MDPI, 13(4):722; DOI: https://dx.doi.org/10.3390/ani13040722
