Authors: Lu D, Miller S, Sargolzaei M, Kelly M, Vander Voort G, Caldwell T, Wang Z, Plastow G, Moore S
(Contact: duclu@uoguelph.ca ) Affiliation: Centre for Genetic Improvement of Livestock, Department of Animal and Poultry Science, University of Guelph, Guelph, ON, Canada Title: Genome-wide association analyses for growth and feed efficiency traits in beef cattle Journal: Journal Of Animal Science, 91 (8): 3612-33 (2013)
DOI :
10.2527/jas.2012-5716 Links:
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Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body weight
Chr.1 : Asso:23626 , Asso:23620 , Asso:23621 , Asso:23627 , Asso:23628 , Asso:23629 . Chr.2 : Asso:23647 . Chr.3 : Asso:23651 , Asso:23653 , Asso:23655 . Chr.4 : Asso:23659 , Asso:23663 . Chr.5 : Asso:23674 , Asso:23676 , Asso:23677 . Chr.6 : Asso:23679 , Asso:23681 , Asso:23682 , Asso:23684 , Asso:23685 , Asso:23686 , Asso:23687 , Asso:23688 , Asso:23689 , Asso:23690 , Asso:23692 , Asso:23693 , Asso:23694 , Asso:23695 , Asso:23696 , Asso:23697 , Asso:23698 , Asso:23699 , Asso:23700 , Asso:23701 , Asso:23702 , Asso:23703 , Asso:23704 , Asso:23705 , Asso:23707 , Asso:23708 , Asso:23709 , Asso:23710 , Asso:23711 , Asso:23712 , Asso:23713 , Asso:23714 , Asso:23715 , Asso:23716 , Asso:23718 , Asso:23719 , Asso:23720 , Asso:23721 , Asso:23722 , Asso:23724 , Asso:23725 , Asso:23726 , Asso:23727 , Asso:23729 , Asso:23730 , Asso:23731 , Asso:23732 , Asso:23735 , Asso:23736 , Asso:23737 , Asso:23739 , Asso:23740 , Asso:23741 , Asso:23742 , Asso:23743 , Asso:23744 , Asso:23745 , Asso:23746 , Asso:23747 , Asso:23748 , Asso:23749 , Asso:23750 , Asso:23751 , Asso:23752 , Asso:23753 , Asso:23754 , Asso:23756 , Asso:23757 , Asso:23758 , Asso:23759 , Asso:23760 , Asso:23761 , Asso:23767 . Chr.7 : Asso:23770 . Chr.8 : Asso:23775 , Asso:23776 , Asso:23777 , Asso:23778 , Asso:23779 , Asso:23780 . Chr.9 : Asso:23787 , Asso:23788 . Chr.10 : Asso:23794 , Asso:23795 , Asso:23796 , Asso:23797 , Asso:23798 . Chr.11 : Asso:23809 , Asso:23820 , Asso:23821 , Asso:23822 . Chr.12 : Asso:23825 , Asso:23826 , Asso:23827 . Chr.13 : Asso:23832 , Asso:23836 , Asso:23837 , Asso:23838 , Asso:23841 . Chr.14 : Asso:23842 , Asso:23843 , Asso:23844 , Asso:23845 , Asso:23846 , Asso:23847 , Asso:23848 . Chr.15 : Asso:23855 , Asso:23856 , Asso:23857 . Chr.16 : Asso:23858 , Asso:23864 , Asso:23865 . Chr.17 : Asso:23870 . Chr.18 : Asso:23871 , Asso:23872 , Asso:23873 , Asso:23875 , Asso:23876 , Asso:23877 . Chr.19 : Asso:23879 , Asso:23881 , Asso:23882 . Chr.20 : Asso:23883 , Asso:23888 , Asso:23889 , Asso:23891 , Asso:23892 . Chr.21 : Asso:23896 , Asso:23897 , Asso:23898 , Asso:23900 , Asso:23902 , Asso:23903 , Asso:23904 , Asso:23905 . Chr.22 : Asso:23908 , Asso:23909 , Asso:23910 , Asso:23911 . Chr.23 : Asso:23918 . Chr.24 : Asso:23921 , Asso:23922 , Asso:23928 . Chr.25 : Asso:23931 , Asso:23932 . Chr.26 : Asso:23933 , Asso:23934 . Chr.27 : Asso:23937 , Asso:23938 . Chr.28 : Asso:23940 , Asso:23942 , Asso:23943 , Asso:23944 .
QTL for Dry matter intake
Chr.1 : Asso:23617 , Asso:23624 , Asso:23635 . Chr.2 : Asso:23644 , Asso:23646 , Asso:23648 , Asso:23669 . Chr.4 : Asso:23660 , Asso:23664 , Asso:23666 , Asso:23673 . Chr.6 : Asso:23691 , Asso:23734 , Asso:23762 , Asso:23764 , Asso:23766 . Chr.7 : Asso:23773 . Chr.8 : Asso:23786 . Chr.9 : Asso:23789 , Asso:23790 . Chr.10 : Asso:23800 , Asso:23802 , Asso:23805 . Chr.11 : Asso:23810 . Chr.13 : Asso:23839 , Asso:23840 . Chr.15 : Asso:23854 . Chr.17 : Asso:23869 . Chr.21 : Asso:23894 . Chr.22 : Asso:23907 . Chr.23 : Asso:23915 . Chr.24 : Asso:23920 . Chr.25 : Asso:23929 . Chr.28 : Asso:23941 . Chr.29 : Asso:23946 .
QTL for Residual feed intake
Chr.1 : Asso:23618 , Asso:23625 , Asso:23639 . Chr.3 : Asso:23670 . Chr.4 : Asso:23665 . Chr.6 : Asso:23706 . Chr.7 : Asso:23769 , Asso:23772 . Chr.8 : Asso:23781 . Chr.10 : Asso:23793 , Asso:23803 , Asso:23804 , Asso:23806 . Chr.12 : Asso:23824 , Asso:23828 . Chr.13 : Asso:23834 , Asso:23835 . Chr.15 : Asso:23852 . Chr.16 : Asso:23859 , Asso:23860 . Chr.18 : Asso:23874 . Chr.19 : Asso:23878 . Chr.20 : Asso:23890 . Chr.22 : Asso:23912 , Asso:23913 . Chr.23 : Asso:23916 . Chr.24 : Asso:23923 , Asso:23924 , Asso:23925 . Chr.25 : Asso:23930 . Chr.27 : Asso:23936 .
QTL for Average daily gain
Chr.1 : Asso:23619 , Asso:23623 , Asso:23630 , Asso:23631 , Asso:23632 , Asso:23633 , Asso:23634 , Asso:23636 , Asso:23637 , Asso:23638 . Chr.2 : Asso:23640 , Asso:23641 , Asso:23668 . Chr.3 : Asso:23652 , Asso:23656 . Chr.4 : Asso:23657 , Asso:23661 , Asso:23662 , Asso:23671 . Chr.6 : Asso:23755 . Chr.8 : Asso:23782 , Asso:23785 . Chr.9 : Asso:23791 , Asso:23792 . Chr.10 : Asso:23799 . Chr.11 : Asso:23808 , Asso:23813 , Asso:23814 , Asso:23815 , Asso:23816 , Asso:23817 . Chr.13 : Asso:23829 , Asso:23830 , Asso:23831 . Chr.20 : Asso:23887 . Chr.21 : Asso:23901 . Chr.27 : Asso:23935 . Chr.28 : Asso:23939 , Asso:23945 .
QTL for Metabolic body weight
Chr.1 : Asso:23622 . Chr.2 : Asso:23642 , Asso:23643 , Asso:23645 , Asso:23649 . Chr.3 : Asso:23650 , Asso:23654 . Chr.4 : Asso:23658 , Asso:23667 , Asso:23672 . Chr.5 : Asso:23675 . Chr.6 : Asso:23678 , Asso:23680 , Asso:23683 , Asso:23717 , Asso:23723 , Asso:23728 , Asso:23733 , Asso:23738 , Asso:23763 , Asso:23765 , Asso:23768 . Chr.7 : Asso:23771 . Chr.8 : Asso:23774 , Asso:23783 , Asso:23784 . Chr.10 : Asso:23801 . Chr.11 : Asso:23807 , Asso:23811 , Asso:23812 , Asso:23818 , Asso:23819 , Asso:23823 . Chr.13 : Asso:23833 . Chr.14 : Asso:23849 , Asso:23850 . Chr.15 : Asso:23851 , Asso:23853 . Chr.16 : Asso:23861 , Asso:23862 , Asso:23863 , Asso:23866 . Chr.17 : Asso:23867 , Asso:23868 . Chr.19 : Asso:23880 . Chr.20 : Asso:23884 , Asso:23885 , Asso:23886 . Chr.21 : Asso:23893 , Asso:23895 , Asso:23899 . Chr.22 : Asso:23906 . Chr.23 : Asso:23914 , Asso:23917 , Asso:23919 . Chr.24 : Asso:23926 , Asso:23927 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (23) ,
Chr.2 (12) ,
Chr.3 (8) ,
Chr.4 (14) ,
Chr.5 (4) ,
Chr.6 (91) ,
Chr.7 (5) ,
Chr.8 (13) ,
Chr.9 (6) ,
Chr.10 (14) ,
Chr.11 (17) ,
Chr.12 (5) ,
Chr.13 (13) ,
Chr.14 (9) ,
Chr.15 (7) ,
Chr.16 (9) ,
Chr.17 (4) ,
Chr.18 (7) ,
Chr.19 (5) ,
Chr.20 (10) ,
Chr.21 (13) ,
Chr.22 (8) ,
Chr.23 (6) ,
Chr.24 (9) ,
Chr.25 (4) ,
Chr.26 (2) ,
Chr.27 (4) ,
Chr.28 (7) ,
Chr.29 (1) .
Number of gene-based eQTL/associations:
Cite this Dataset :
Animal QTLdb: Dataset from Lu D, Miller S, Sargolzaei M, Kelly M, Vander Voort G, Caldwell T, Wang Z, Plastow G, Moore S (2013). Genome-wide association analyses for growth and feed efficiency traits in beef cattle. Journal of animal science, 91 (8): 3612-33;
Curated into QTLdb on 2014-01-21. Universal link to this data set:
https://www.animalgenome.org/QTLdb/supp/?t=FcQp9W6AzI
OR
Lu D, Miller S, Sargolzaei M, Kelly M, Vander Voort G, Caldwell T, Wang Z, Plastow G, Moore S (2013). Genome-wide association analyses for growth and feed efficiency traits in beef cattle. Journal of animal science, 91 (8): 3612-33; DOI: https://dx.doi.org/10.2527/jas.2012-5716
